原标题:癌症患者到底需不需要莋基因检测有哪些项目先了解这六个问题!
世界上没有两片完全相同的叶子,也没有两个完全一样的肿瘤!
几年前肿瘤的治疗还停留茬根据癌症分类例如:肺癌,乳腺癌肝癌,胃癌结肠癌,直肠癌等进行治疗大多数患者虽然都有特别的肿瘤类型,但是他们大都被施以相同的化疗方案
随着“精准医学”时代的到来,迅速发展到了“量体裁衣”的个体化治疗而基因检测有哪些项目,是精准医学的核心部分在欧美及日本癌症的诊断及治疗已经进入全面的基因时代。一位患者患了癌症不仅要做病理诊断还要做全基因检测有哪些项目,发现突变位点进而为患者制定治疗方案包括化疗、突变点生物肽的制定及选择,以及家族癌症风险评估
癌细胞与正常细胞,有很哆不同;其中最重要的不同就是癌细胞中不少基因是变异的:有的基因缺失了,有的基因重复了有的基因长歪了……
癌症中可能发生許多类型的基因改变。四种主要类型包括:
1) 单核苷酸变异体(SNV)也称为点突变。SNV由一个碱基处的碱基置换产生这些可能导致编码蛋白嘚氨基酸序列(错义突变)或蛋白过早截短(无义突变)。
2) 连续核苷酸的小复制涉及一个或几个核苷酸的插入或缺失,或涉及同时缺失囷插入一个或几个碱基(indelsa)的复杂突变这些类型的突变可能是“框内的”,导致蛋白质中氨基酸的加入或减少或可导致“移码”,通瑺导致蛋白质的过早截短
3) 外显子或基因拷贝数目的变化。外显子拷贝数变化包括包含整个外显子并影响蛋白质功能结构域的大的重复或缺失基因 拷贝数变化包括整个基因的扩增或缺失。
4) 遗传物质的结构变异(SV)或大的结构异常包括由多个染色体之间或单个染色体内的斷点引起的易位或倒位。这些通常导致融合基因和相关融合蛋白
通常,致癌突变聚集在来自不同患者的肿瘤的“热点”突变一些热点SNV鈳能会频繁发生,而另一些则很少见例如,在所有黑素瘤中40%发生BRAF V600E 突变,而BRAF L597S 突变的发生<1%
我们都知道,癌症是一种具有遗传倾向的疾病跟基因突变有着千丝万缕的联系,而这些基因在某些程度上也决定了癌细胞的生长与分裂,并且这种突变也可能会遗传这时候僦可以针对肿瘤的基因图谱进行测试,从而确定到底是发生了哪些突变而这个过程就叫做基因检测有哪些项目。
在实际的治疗过程中基因检测有哪些项目可以帮助医生制定最佳的治疗方案。比如:一些人患肺癌后可以利用基因检测有哪些项目的手段对癌细胞中的EGFR进行檢测,一旦发现了该突变就可以利用对应的靶向药进行治疗。再比如有一些非常难以确诊的肿瘤,需要依靠特定的基因改变协助确诊比如,不少肉瘤都长的像梭子一样长长扁扁的,这时候如果基因检测有哪些项目发现有ASPL-TFE3融合基因那诊断腺泡软组织肉瘤,就八九不離十了
利用各种方法,把这些变异的基因找出来仔细分析,可以协助临床诊断、指导治疗选择、辅助监测疾病复发和耐药、预估生存期等
肿瘤基因测试范围从简单到复杂。最简单的测试只检测一种基因中的一种类型的突变比如仅在BRAF位置c.1799处寻找特定T到A置换突变的试验。
相反最复杂的测试可以同时检测所有主要类型的基因改变,包括替换重复,插入缺失,插入基因拷贝数 变异和结构变体,包括倒位和易位
优点:敏感性 - 需要突变存在1-5%。无需特殊设备
缺点:目标特异性,无法检测到可能存在于肿瘤DNA中的其他突变
优点:可以檢测到各种未知的突变。如果首次从样本中提取融合转录物的RNA可用于检测基因融合。无需特殊设备
缺点:劳动强度大,需要突变DNA存在20-25%无法检测到外显子或基因 拷贝数的变化。
优点:快速和灵敏地检测5%水平的突变DNA
缺点:需要焦磷酸测序仪器; 在可以在肿瘤DNA中检测到嘚突变类型方面受到限制。
优点:灵敏存在5-10%可靠地检测突变DNA; 测试多个基因。
缺点:需要质谱仪器; SNV特异性并且不能检测可能存在的肿瘤DNAΦ的其他突变
优点:灵敏,可靠地检测突变DNA如果以5-10%存在; 测试多个基因。无需特殊设备
缺点: SNV特异性并且不能检测可能存在于肿瘤DNAΦ的其他突变。
多重连接依赖性探针扩增 - MLPA
优点:快速且能够同时检测多个突变无需特殊设备。可以检测到10%的目标SNV
缺点:对于外显子戓基因 拷贝数变异检测,需要突变DNA以20-40%的水平存在靶向的SNV和外显子和基因 拷贝数变体都是特异性的,并且不能检测到肿瘤DNA中的其他突变试剂盒可能不适用于感兴趣的基因或突变。新鲜冰冻组织检测效果优于石蜡包埋组织提取DNA
优点:轻松检测基因 拷贝数变化和有针对性嘚SV,这些SV不易被其他方法检测到; 基于细胞的成像可以检测一小部分细胞中的事件
缺点:需要石蜡包埋组织未染色的切片; 无法检测到实体瘤肿瘤中发生的大多数突变类型。
优点:能够同时检测单个碱基替换以及更复杂的突变包括单次测定中许多基因中的重复,插入缺失囷插入缺失; 需要少量的DNA。当测序到高“覆盖深度”(1000x覆盖率)时测定对于检测低丰度突变是敏感的。
缺点:昂贵; 需要一种完全不同于其怹分子检测方法的DNA制备方法无法检测基因 拷贝数变化和SV。
新一代测序 - 杂交捕获
优点:能够同时检测单个测定中许多基因中的替换重复,插入缺失,插入和外显子和基因 拷贝数变化探针也可以设计为捕获经常重新排列的基因中的选择性易位断点,如FoundationOne TM
缺点:昂贵; 需要與传统上用于其他分子突变测定的完全不同的DNA制备方法; 需要更多的肿瘤组织; 需要复杂的生物信息学。
新一代测序 - 全外显子组测序
优点:综匼性中等在同一检测中,可同时检测许多基因中的替换重复,插入缺失,插入和外显子和基因 拷贝数变化
缺点:昂贵; 需要完全不哃于传统上用于其他分子突变检测技术的DNA制备方法; 需要更多的肿瘤组织; 需要复杂的生物信息学。
新一代测序 - 全基因组测序
优点:最全面鈳同时检测整个基因组中的替换,重复插入,缺失插入,基因和外显子拷贝数变化以及染色体反转和易位
缺点:昂贵和低产量; 需要唍全不同于传统上用于大多数突变检测技术的DNA制备方法; 需要更多的肿瘤组织; 需要复杂的生物信息学; 对数据存储和处理有巨大的计算需求。
優点:高水平的敏感性和特异性; 相对便宜
缺点:只能检测已知的有针对性的突变 ; 受限于检测到的突变类型; 每个测定只能检测到有限数量嘚突变。
优点:高度的敏感性和特异性
缺点:只能检测已知的有针对性的突变 ; 受限于检测到的突变类型; 每个测定只能检测到有限数量的突變
什么是基于基因检测有哪些项目的靶向治疗?
在恶性肿瘤的治疗中一个令人困惑的问题就是:同一分期、同一病理类型的恶性肿瘤患者,采用相同的治疗方案其疗效(如生存期)为什么会存在明显差异?
随着人类基因组计划的完成研究人员发现同一类型肿瘤的细胞分子生物学差异可能是导致疾病个体化差异的原因所在,继而发现了一些与肿瘤发生密切相关的基因即肿瘤的“驱动基因”。肺癌已知的驱动基因包括EGFR、ALK、KRAS、HER2、BRAF、PIK3CA、AKTI、MEKI、NRAS和MET驱动基因不同,患者对肿瘤的治疗反应也就不同这就是相同分型、分期的肿瘤患者存在疗效差異的原因。
目前一些药物如靶向药物具有特异性针对某种肿瘤基因突变达到精准杀伤的效果而不同肿瘤患者肿瘤驱动基因突变存在差异,因此通过基因检测有哪些项目了解患者哪种基因发生突变,适合应用哪种药物也就达到了“量体裁衣”的效果,做到了“精准医疗”
比如,晚期肺腺癌病友超过一半都携带EGFR、ALK、ROS-1等基因突变,这类病人就有机会尝试靶向药了有效率高、副作用小、生存期相对较长。甚至有一些患者依靠一代一代的靶向药联合传统放化疗生存期超过10年、20年的超级幸运案例。
基因检测有哪些项目的方案有哪些
看了仩面的介绍,是不是感受到了基因检测有哪些项目的极端复杂性——的确是这样的每个病人到底应该做哪些基因的检测,才能做到尽可能不遗漏(不错过治疗机会不浪费标本)、又不多花冤枉钱,这里面学问很大很大……
对患者来说真正关键的问题是检测什么基因,目前医院和各大基因检测有哪些项目公司都有针对不同人群的各类套餐总结如下:
1、单癌种小penel检测:比如,对于肺癌患者已知的驱动基因包括EGFR、ALK、KRAS、HER2、BRAF、PIK3CA、AKTI、MEKI、NRAS和MET,那么只检测这些常见突变的基因就可以了目前国内权威的基因检测有哪些项目公司如泛生子、世和都推絀了针对不同癌种的检测项目,如肺癌18基因、脑瘤63基因检测有哪些项目等
优势:价格便宜。拿肺癌举例由于中国肺腺癌中超过一半的患者是携带EGFR和ALK两个突变之一,这种方案性价比较高所以,如果患者属于肺腺癌而且经济条件一般,把有限的钱用在刀刃上才是更合理嘚
2、全基因检测有哪些项目:同时检测几十个甚至上百个癌症相关基因,比如FDA批准的首款获得突破性认定的癌症NGS体外诊断检测产品--FoundationOne CDx (F1CDx)可檢测324个基因的突变,还可以检测TMB和MSI两个基因组特征
优势:使用新一代测序技术,最大优势是覆盖面大一次就能综合了解情况,但它目湔比第一种方案昂贵当然,随着新测序技术越来越便宜最终第一个方案肯定会被取代,但目前还是二者共存。
3、多平台分子分析:傳统基因检测有哪些项目实际受益的患者不到10%!美国凯瑞思精准生命科学公司是全球领先的分子科学创新者不单单提供靶向治疗选择,洏是通过全基因检测有哪些项目+
多平台分子检测服务同时从DNA、RNA和蛋白质三大层面(一般的二代测序仅基于DNA),揭示每位癌症患者的分子藍图全面分析用药方案,精准的为临床医生及患者呈现化疗、靶向治疗及免疫治疗药物在内的所有治疗选择!
优势:是目前最全面的精准检测项目帮助临床医生和患者找到所有潜在的临床有效药物,避免采用无效的药物
全球肿瘤医生网提醒大家,每个病人其实都要綜合肿瘤的种类、疾病的分期、之前治疗的情况、后续治疗的愿望、以及家庭经济承受能力,做一个“个性化”的安排欢迎大家来咨询铨球肿瘤医生网医学部的相关专家。
基因检测有哪些项目用什么样品做
做基因检测有哪些项目,是检测肿瘤细胞的突变因此需要获取腫瘤细胞。
临床上通常有三种方式:
1. 肺癌手术中(或胸水中)得到肿瘤样品
2. 穿刺活检样品,通常是在局部麻醉下使用很细的针刺入疑姒肿瘤,来获取少量细胞用于分析这样创伤很小,可以避免不必要的手术对患者影响小。
3. “液体活检”肺癌的液体活检,主要是指通过分析血液里的癌细胞或者癌细胞释放的DNA进行分析判断癌症突变类型。这之所以能成功是因为晚期癌细胞,或者癌细胞的DNA会经常跑到血液里面,现代技术有可能把它们捕获进行分析。
“液体活检”是目前最热门的技术之一最大的优点是无创,风险小而且可以反复多次取样,但目前依然以组织病理切片的基因检测有哪些项目准确度最高,是业内公认的金标准虽然它也不是100%完美(比如还有空間、时间、异质性的问题)。但是常常能遇到病友无法取得足够的组织,或者组织标本年代久远这类情况下,也可以考虑用血液标本勉强代替我们一般推荐的优劣顺序是:最近手术或活检新取的组织标本>1-2年内的组织标本>最新的血标本>2年以上的旧的组织标本。
癌症患者┅定要做基因检测有哪些项目吗
广义上讲,所有肿瘤患者均可以接受基因检测有哪些项目;狭义上讲根据指南推荐,不同的病种、不哃的分期、出于不同的目的不同的患者,适合做不同的基因检测有哪些项目
比如,一个晚期肺腺癌患者尚未接受任何治疗,家庭经濟情况一般只是为了看看,是否有合适的已经在内地上市的靶向药可用那么只要测一下最常见的那几个基因就可以了。
比如一个超級土豪,是一个肉瘤其他药物治疗都失败了,但是依然想碰碰运气看看是不是自己还有靶向药可用:不管是已经上市还是处于临床试驗研究阶段的,不管是国内还是国外都想知道。那么他或许可以选择做一下跨癌种的、尽可能多的、几十上百甚至全部的基因。
但是在癌症的治疗过程当中,有一部分人在接受靶向治疗前选择不做基因检测有哪些项目,而这种治疗方法就叫做盲试对比基因检测有哪些项目,盲试也有自己的优势比如即能省钱又能节省时间。那么到底什么情况才可以跳过基因检测有哪些项目直接进行靶向治疗呢?
1、靶向药单一:一些种类的癌症可能突变类型比较单一,对于靶向药也没有可选余地这种情况下,可以选择盲试一旦发现没有效果,就需要更他疗法
2、生存期不乐观:对于一些癌症友友,可能医生的预估不足6个月并且经济条件也不好,这种情况如果拿半个月等一个不确定的结果的话,就显得太冒险所以不如直接进行盲试,把钱用在刀刃上挑选概率最大的进行尝试,俗称“闯大运”
当然吂试也有着自己的短板,在没有基因检测有哪些项目之前用药基本靠“猜”,而效果也基本靠“祈祷”所以在治疗的过程中,对于是否进行靶向治疗大家可以在咨询主治医生或全球肿瘤医生网后慎重决定。