请请听下回分析一下

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最近TA克隆老是失败,请大家分析一下。
PCR产物,胶回收后TA克隆,板子总长成这样,请高手分析一下原因。taq酶,宝生物的;胶回收试剂盒,全式金的;T载体,用过生工和全式金的。感受态细胞,全式金和自己制备的。之前还做出来了,上学的时候TA克隆也没出过问题,现在涂的板子老是长成下面图片这样。我自己动手做了一次,2个研究生做了一次都是下面的结果(图1:准备回收的目的片段;图2-4,平板菌液,学生发过来的,忘记那一个是水做的对照)。分析不出来原因,请高手分析一下。谢谢!
我已经把涂菌改为50ul了。请问板子中一团糊的也是因为浓度太高的缘故?
首先谢谢你详细的回答。关于你分析的几个原因,我做一下说明,你看还有没有什么建议:
1、目的片段大约750bp,我用的是2K的marher。转化之后复苏时间1个小时左右,有的时候时间比较长(不超过2小时),没有集菌。涂板用量50ul。个人感觉摇菌时间这一块应该可以优化,缩短一下时间看看效果。
2、感受态,买的感受态和自己制备的感受态现在都出现这种状况。之前我自己做的,做出实验结果的感受态细胞也是目前这种情况。感受态这一块拿不准,买的感受态,自己制作的和学生做的,都出现这样的状况。
3、Amp的问题。这个之前没考虑到,一直以为可能是载体和感受态的问题,两个都换过还是没有解决问题。Amp准备重新定一只新的。涂板只用了Amp,IPTG和x-gal没有用。
4、阴阳性对照,学生报道说也是上述情况。上述图片其中一个是加水的对照。
5、请问板子中一团糊的也是因为浓度太高的缘故,还是其他原因?涂板用量已经缩小到50ul。涂板不均匀这个试验中很常见,挑到目的基因克隆子即可。一团糊的我一直难以理解,重新做新的培养基也是这个情况。要说浓度高,上学的时候经常做,浓度也有非常高的,可没有出现过一团糊的情况。
& & 读书时做TA克隆基本没有失败过,目前出现这种情况换了一些试剂盒条件,始终没有找到有效的解决办法。
你的意思负对照也长了?
是的,加水的也是类似情况。不知是否与Amp有关?
按你说的情况,加水也出现上述情况,那么就只有两种原因了,就是我说的第二三两种,按你所说感受态出问题的可能性不大,那么就是抗生素的问题了,你可以挑取五到十个菌斑,用M13通用引物进行PCR验证,如果绝大部分有产物,说明抗生素没问题,如果大部分无产物,抗生素失效,不过前提是感受态没问题,最好换换抗生素吧
做TA克隆一团糊,基本就是平板菌量太高所致,有两个方面,一方面是转化效率太高,主要是目的片段太短,复苏时间过长,过分集菌以及培养时间过长等原因所致,第二方面就是抗生素起不到作用,这又有两个方面,一是抗生素失效,无法杀死空菌,二是抗生素假失效,即感受态本身含有T质粒,无论该质粒连接的是什么片段,抗生素均不能将其杀死,导致糊成一片,从而表现出抗生素失效。
从你给出的数据,出问题的可能是第二方面的第一点,换个抗生素试试吧
你好,这是我重新做实验的结果,重新PCR扩增,胶回收,TA克隆,LB培养基(全部新买的试剂),Amp(用的还是之前买的生工的,新买的氨苄粉末由于超纯水仪器坏了,怕水质太差,没有配)。摇菌复苏1小时,涂板菌液取了50ul,没有富集。这是板子生长的结果(目的基因的,没做对照),挑去白斑检测结果全是空载体。一团一团糊一样的东西,我在网上也查找了一下,有点人说是感受态的死细胞。不知道是否正确?这种结果,是否需要将所有的试剂全换一遍?
IMG_659.jpg
刚刚我们实验室师弟师妹也出现了这种情况,涂得平板一团糊,我检查了一下,原因相当简单,复苏用的培养基污染了,长满了菌还在用,所以出现这种情况的原因很多的,建议你还是先用新的AMP试试,你所说的感受态死细胞,个人觉得可能性不大,既然是死细胞就不会生长,不会生长怎么会糊成一片呢?
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结果图,请大家帮帮忙 分析一下
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待解决问题
悬赏丁当:5
右边的 IP是免疫沉淀,左边的IB 是western blot, 那右边的TCL是什么意思?还有,最上面的LAMTOR1是指 在IP时 用的一抗是LAMTOR1吗?
不知道邀请谁?试试他们
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西瓜葡萄开心右边的 IP是免疫沉淀,左边的IB 是western blot, 那右边的TCL是什么意思? 还有,最上面的LAMTOR1是指 在IP时 用的一抗是LAMTOR1吗?有没有整个文献原文?
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TCL应该是total cell lysates。总蛋白提取物
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