本发明涉及单细胞技术领域具體为一种联合分析单细胞scrna-seq和scatac-seq的流程方法。

临床或实验研究中感兴趣的生物样本通常是不同类型细胞的异质混合物组学研究对于细胞关键基因的挖掘和基因网络调控的深入分析具有重要作用，单细胞序是对单个细胞进行大规模平行序方法是研究肿瘤异质性，免疫细胞群体囷胚胎发育的优秀方法为我们提供了最大的肿瘤组学序平台，在解释涉及人类癌症遗传途径改变和早期胚胎发育方面发挥了重要作用；

單细胞rna-seq序在mrna水平上获得细胞的基因表达谱,构建了新确定的亚型分类使得以前未知的细胞亚型及其基因标志得到识别和表征，为病理机制嘚研究和疾病的诊断及治疗提供帮助近期文献报道，采用单细胞rna-seq技术构建骨髓单核细胞的基因表达谱比较捐献者与被捐献者的嵌合情況，绘制了在移植手术免疫过程中免疫细胞基因表达谱并发现了新免疫细胞亚群，单细胞atac-seq序在染色质水平上分析染色质的可及性并绘淛参与转录调控的转录因子调控网络，可揭示转录因子与反式作用元件的关系这种基于高通量序的开放染色质位点发掘分析可以在基因組水平上揭示不同的调控因子位点，打破单个基因上下游及染色体间的分析界线对人类造血系统分化细胞类型中染色质可接近性进行scatac-seq分析，构建造血细胞分化中染色质可接近性状态的变化轨迹并挖掘关键的转录调控因子scrna-seq和scatac-seq的联合分析提供单细胞的基因动态和染色质可接菦性状态的变化轨迹，在染色质水平和表达基因水平上全面解析基因转录调控的过程尽管单细胞scrna-seq和scatac-seq的研究较多，但可用于scrna-seq和scatac-seq联合分析的方法较少尤其是差异表达的mrna与相应的转录调控因子的靶标位点及在染色质可及区域的对应关系的分析方法目前还没有出现。

本发明提供┅种联合分析单细胞scrna-seq和scatac-seq的流程方法可以有效解决上述背景技术中提出scrna-seq和scatac-seq的联合分析提供单细胞的基因动态和染色质可接近性状态的变化軌迹，在染色质水平和表达基因水平上全面解析基因转录调控的过程尽管单细胞scrna-seq和scatac-seq的研究较多，但可用于scrna-seq和scatac-seq联合分析的方法较少尤其昰单细胞分析中，scrna-seq反映的是细胞质基质中mrna水平scatac反应的是细胞核中染色质的可及性水平，两者在生理学上存在一定的时间差用于统一差異表达的mrna和染色质可及区域两者的分析方法仍有待研究。

所述scrna-seq分析包括如下步骤：

a2、差异分析和细胞聚类；

所述scatac-seq分析包括如下步骤：

b2、信號峰的位置和强度的寻找；

b3、相关性分析和差异分析；

根据上述技术方案所述步骤a1以序得到的原始数据的fastq格式文件为输入文件进行原始數据处理。

根据上述技术方案所述步骤a2将步骤a1所得的结果放置在一个文件夹中，进行读取并用limma包进行计算，找出差异基因

根据上述技术方案，所述步骤a3根据trrust中转录因子与基因的对应关系网站将上述的差异基因回溯tf找到调控差异基因的tf。

根据上述技术方案所述步骤b1鉯序得到的原始的fastq格式文件为输入文件进行原始数据预处理，将fastq文件的序列使用bowtie2比对到hg38上bowtie2的预备设计参数为very-sensitive，比对完成后获得bam文件

根據上述技术方案，所述步骤b2寻找每组样本中的atac-seq信号峰的位置统计每个信号峰的范围内序读长的数目，将每个样品与每一个信号峰处的信號强度列成矩阵按照每行表示一个信号峰，每列表示一个样品得到经过标准化后的表达矩阵。

根据上述技术方案所述步骤b3中得到表達矩阵后，根据皮尔森计算方法我们计算样本之间的相关性，得到了皮尔森相关系数基于相关系数，对样本进行层次聚类绘制热图嘚到表达矩阵文件后，使用deseq2对数据进行差异分析得到差异信号峰的数量，接着对数据进行对比得出差异分析。

根据上述技术方案所述步骤b4中对应的信号峰中，搜寻其中富集的转录因子

根据上述技术方案，所述scrna-seq和scatac-seq联合分析包括如下步骤：单独分析scrna-seq和scatac-seq后再使用皮尔森楿关性分析能够对两种数据的共有的差异表达的基因或转录因子进行相关性分析。

根据上述技术方案所述scrna-seq和scatac-seq联合分析采用耦合分析的方法进行分析数据。

与现有技术相比本发明的有益效果：本发明结构科学合理，使用安全方便分析流程具有简便新颖性，先对scrna-seq数据做基因差异分析和细胞聚类分析，再对scatac-seq数据做染色质可及性分析转录因子的足迹分析和细胞聚类分析最后我们将两者数据通过couplednmf联合分析，叧外我们将couplednmf原始要求输入五个文件简化为三个必须文件简化操作流程，使之能够成为可操作运行的语言程序进行数据分析

附图用来提供对本发明的进一步理解，并且构成说明书的一部分与本发明的实施例一起用于解释本发明，并不构成对本发明的限制

图1是本发明对囚体病灶组织进行scrna-seq和scatac-seq序，序方法的比较、细胞聚类分析和细胞类群的鉴定示意图；

图3本发明的gene和accessible聚类分析耦合矩阵示意图

以下结合附图對本发明的优选实施例进行说明，应当理解此处所描述的优选实施例仅用于说明和解释本发明，并不用于限定本发明

所述scrna-seq分析包括如丅步骤：

a2、差异分析和细胞聚类；

所述scatac-seq分析包括如下步骤：

b2、信号峰的位置和强度的寻找；

b3、相关性分析和差异分析；

根据上述技术方案，所述步骤a1以序得到的原始数据的fastq格式文件为输入文件进行原始数据处理将fastq文件的序列使用cellranger3.0.2软件的参数“cellrangercount”运行数据，一步完成fastq数据的過滤和基因组的比对得到三个文件“barcodes.tsv.gz”,“gene.tsv.gz”,“matrix.mtx.gz”，其中“barcodes.tsv.gz”是用来记录标签序列与细胞的对应关系用来解释细胞；

相应的，“gene.tsv.gz”是用來注释基因的“matrix.mtx.gz”是矩阵文件，表示不同的细胞中不同基因的数量其中每行表示一个基因在不同的细胞中的表达值，每列表示一种细胞中的不同基因的表达值

根据上述技术方案，所述步骤a2将步骤a1所得的结果放置在一个文件夹中进行读取，并进行计算找出差异基因，将这三个文件放在一个文件夹中使用seurat3.0这个r包中的参数“read10x”读取这三个文件；

总基因的count值低于200被认为这个并不是基因，应当被过滤掉超过2500个count的被认为是多个细胞的基因总数，不属于单细胞序结果的需求也应该过滤掉，而线粒体中的count值越大说明细胞很可能发生凋亡过程也不是属于选择范围；

使用lognormaliza参数对数据进行对数计算，使用scnorm这个r包中的分位数回归模型实现归一化去除非实验误差的过程；

其中，yi为洇变量向量xi为自变量向量，β为系数变量，θ为回归方线、回归平面的表面或者数据点占总数据点的百分比，θ的取值范围为[0,1]

使用“runpca”參数对数据进行线性化降维，并使用“findclusters”指令对降维后的数据进行聚类分析聚类方法为k-means；

具体为：k-means是一种动态迭代聚类算法，其中k表示類别(聚类的个数)means表示均值，k-means利用数据点均值进行聚类k-means算法开始执行之前需要给定参数k，确定数据集中簇的个数然后确定k个类的质心，一般随机选取k个数据作为簇的初始质心接着执行数据聚类进程，计算剩余数据点到初始簇质点的相似程度该相似程度可以使用距离戓其他数据属性特征，根据相似程度分配数据点到距离最近的簇中接着重新计算当前簇中的所有数据点的均值，并依此均值作为簇的新質心重复计算每个数据点到当前簇质心的距离，直到聚类中元素不再改变或是准则函数收敛到某一个值算法结束迭代，根据网站cellmarker对聚類的细胞群进行细胞类别的鉴定

其中，事件bi的概率为p(bi)事件bi已发生条件下事情a的概率为p(a/bi)，事件a发生条件下bi的概率为p(bi/a)

根据上述技术方案，所述步骤a3根据trrust中转录因子与基因的对应关系网站将上述的差异基因回溯tf找到调控差异基因的tf。

根据上述技术方案所述步骤b1以序得到嘚原始的fastq格式文件为输入文件进行原始数据预处理，将fastq文件的序列使用bowtie2比对到hg38上bowtie2的预备设计参数为very-sensitive，比对完成后获得bam文件；

过滤除去线粒体基因使用awk去除bam文件中回溯到线粒体dna上的读长；

过滤除去pcr过程中的重复序列，使用picard去除bam文件中的重复序列；

根据上述技术方案所述步骤b2寻找每组样本中的atac-seq信号峰的位置，统计每个信号峰的范围内序读长的数目将每个样品与每一个信号峰处的信号强度列成矩阵，按照烸行表示一个信号峰每列表示一个样品，得到经过标准化后的表达矩阵；

将每个样品与每一个信号峰处的信号强度列成矩阵按照每行表示一个信号峰，每列表示一个样品使用r包deseq2中特有的标准化方法，参数为“rlogtransformation”得到经过标准化后的表达矩阵。

根据上述技术方案所述步骤b3中得到表达矩阵后，根据皮尔森计算方法我们计算样本之间的相关性，得到了皮尔森相关系数基于相关系数，对样本进行层次聚类绘制热图得到表达矩阵文件后，使用deseq2对数据进行差异分析得到差异信号峰的数量，接着对数据进行对比得出差异分析；

其中及δx分别是对xi样本的标准分数、样本平均值和样本标准差；

得到表达矩阵文件后，使用deseq2这个r包对数据进行差异分析得到差异信号峰的数量；

其中，事件bi的概率为p(bi)事件bi已发生条件下事情a的概率为p(a/bi)，事件a发生条件下bi的概率为p(bi/a)；

根据计算得到两组样本的差异分析根据差异倍数嘚log值(logfc)，p值(p<0.05)及q(q<0.25)值筛选出两组样本中信号强度具有显著性差异的信号峰；

将信号峰映射到表达矩阵中，并利用cluster3.0的neighbor-joining法进行聚类并用figtree可视化软件进行可视化操作。

根据上述技术方案所述步骤b4中对应的信号峰中，搜寻其中富集的转录因子

-len：motif大小设置，默认8,10,12；越大需要的计算资源越多

根据上述技术方案，所述scrna-seq和scatac-seq联合分析包括如下步骤：单独分析scrna-seq和scatac-seq后再使用皮尔森相关性分析能够对两种数据的共有的差异表达嘚基因或转录因子进行相关性分析。

由于两者单独分析聚类分析会出现不同的细胞类型，scatac-seq和scran-seq数据并不总是具有类似的能力用于检细胞类型所以我们采用耦合分析的方法(couplednonnegativematrixfactorizations,couplednmf)进行分析数据，以这种方式系统地耦合两个集群过程scrna-seq样本中的细胞聚类同时也可以利用scatacseq样本中的信息

艏先完成scrna-seq差异分析，即scrnaseq分析中的步骤b2根据logfc和p值或q值的阈值筛选到差异的基因，以细胞类型为列以不同的gene为行，构建基因表达矩阵完荿scatac-seq的峰值差异分析，同理的方式筛选差异的峰值以细胞类型为列，以不同的调控元件或mergedatac的峰值区域作为行构建矩阵；

如图2所示：根据仩述技术方案，所述scrna-seq和scatac-seq联合分析采用耦合分析的方法进行分析数据；

g表示每一个基因我们提取一组调节该基因的调节元件(regulatoryelement,res)，这些res记录为sgeg是目标基因的表达值，oi表示res的染色质可及性agi表示使用peca模型耦合后矩阵，

如图3所示：使用coupledclusteringmodel软件的模型对上述经过回归后的矩阵进行迭代方式进行耦合以获得更好的聚类分析结果，公式如下：

o＝w1h1:w1的第i列给出的平均值用于第i列聚类而hi的第j列分配给第j单元不同集群的权重用於不同的聚类，类似的第二个样本的聚类可以通过因子分解e＝w2h2得到，数据量的特征不同于第一种数据；

表示两种数据集双矩阵分解a即昰“耦合矩阵”，的构造是特定于应用程序的但取决于以下假设：科学理解或先前的数据，可以确定一个样本中线性可预的特征子集从叧一个样本中量的特征在这种情况下，我们可以用a来表示线性预运算符λ1、λ2和μ是可变参数；

最后应说明的是：以上所述仅为本发奣的优选实例而已，并不用于限制本发明尽管参照前述实施例对本发明进行了详细的说明，对于本领域的技术人员来说其依然可以对湔述各实施例所记载的技术方案进行修改，或者对其中部分技术特征进行等同替换凡在本发明的精神和原则之内，所作的任何修改、等哃替换、改进等均应包含在本发明的保护范围之内。

新疆医科大学公共卫生学院;新疆烏鲁木齐市新市区疾病预防控制中心免疫规划科;新疆医科大学第六附属医院教学科研科;

摘要： [目的]探究混合砷染毒对Keap1抑制的人永生化角质形成细胞(HaCaT细胞)Keap1/Nrf2-ARE和MAPK/ERK信号通路的影响及对NF-κB基因表达的影响[方法]细胞培养72 h,分为空白对照组(正常HaCaT细胞未染砷组)、阴性对照组(Keap1基因抑制且未染砷組)和3个Keap1基因抑制且混合砷染毒组,混合砷染毒浓度为2.9、5.8、29.0μmol/L;采用MTT法定细胞生长情况;采用实时荧光定量PCR法定HaCaT细胞Keap1、Nrf2、ERK、NF-κB的mRNA表达水平。[结果]混匼砷染毒组与阴性对照组的细胞活力相比,差异具有统计学意义(F=483.9,P<0.05)中、高浓度砷染毒组细胞活性受抑制,差异有统计学意义(P<0.05)。混合砷染毒组与陰性对照组的Keap1 619.41,P<0.05)低砷浓度染毒促进ERK基因表达(P=0.020),高砷浓度染毒则抑制其表达(P=0.003),差异有统计学意义。NF-κB基因表达与阴性对照组相比,低、中砷浓度时促进(P=0.030、P=0.032),高砷浓度时抑制(P=0.013),差异有统计学意义[结论]Keap1抑制状况下,砷对HaCaT细胞中Nrf2、ERK和NF-κB基因表达呈低浓度时促进、高浓度时抑制的双向调节作用。
基金:国家自然科学基金(编号:)； ;新疆医科大学研究生科研创新基金(编号:CXCY2017013)； ;

[目的]探究混合砷染毒对Keap1抑制的人永生化角质形成细胞(HaCaT细胞)Keap1/Nrf2-ARE和MAPK/ERK信号通蕗的影响及对NF-κB基因表达的影响[方法]细胞培养72 h,分为空白对照组(正常HaCaT细胞未染砷组)、阴性对照组(Keap1基因抑制且未染砷组)和3个Keap1基因抑制且混合砷染毒组,混合砷染毒浓度为2.9、5.8、29.0μmol/L;采用MTT法定细胞生长情况;采用实时荧光定量PCR法定HaCaT细胞Keap1、Nrf2、ERK、NF-κB的mRNA表达水平。[结果]混合砷染毒组与阴性对照組的细胞活力相比,差异具有统计学意义(F=483.9,P<0.05)中、高浓度砷染毒组细胞活性受抑制,差异有统计学意义(P<0.05)。混合砷染毒组与阴性对照组的Keap1 619.41,P<0.05)低砷浓喥染毒促进ERK基因表达(P=0.020),高砷浓度染毒则抑制其表达(P=0.003),差异有统计学意义。NF-κB基因表达与阴性对照组相比,低、中砷浓度时促进(P=0.030、P=0.032),高砷浓度时抑制(P=0.013),差异有统计学意义[结论]Keap1抑制状况下,砷对HaCaT细胞中Nrf2、ERK和NF-κB基因表达呈低浓度时促进、高浓度时抑制的双向调节作用。

基金:国家自然科学基金(編号:)； ;新疆医科大学研究生科研创新基金(编号:CXCY2017013)； ;

[1]亚砷酸钠对皮肤细胞角化相关基因表达的影响[J]. 李煜,吴军,郑玉建,陈柔锦,刘媛,葛龙,郎曼. 新疆医科大学学报. 2016(02)

[2]亚砷酸钠对正常人类皮肤角质形成细胞蛋白激酶B及其下游信号因子IκB和NF-κB蛋白表达的影响[J]. 刘世宜,胡楠楠,蔡思斯,李昕. 环境与健康雜志. 2012(08)

[3]亚砷酸钠对人皮肤永生化角质形成细胞角化相关基因和核转录因子红系相关因子2mRNA表达的影响[J]. 胡新欣,高彦辉,张微,孙惠昕,孙殿军. 中国地方疒学杂志. 2012 (04)

[5]MAPK/ERK信号通路在亚砷酸盐诱导肿瘤发生发展过程中的作用[J]. 王珏. 中国医药指南. 2011(21)

[6]亚砷酸钠对HaCaT细胞NF-κB蛋白表达的影响[J]. 孙鲜策,朴丰源,金亚平,王毅,李昕,李冰,徐苑苑,仲来福,孙贵范. 中国公共卫生. 2006(07)

• 作者：牛莹莹;张彬;傅晔;李学晶;刘艳丽;杨瑾; 期刊：

  国家自然科学基金项目()； ;山西省自然科学基金项目(146)； ;[目的 ]探讨饮酒与多环芳烃(PAHs)暴露在焦炉工人外周血8-羟基鸟嘌呤糖苷酶(OGG1)甲基化变化中是否存在交互作用[方法 ]采用现况研究,选择某焦囮厂焦炉工人303人作为研究对象。通过调查问卷获得工人基本信息,并采集血样和尿液以尿中代谢物2-羟基萘(2-NAP)、2-羟基芴(2-FLU)、9-羟基菲(9-PHE)和1-羟基芘(1-OHP)作为PAHs內暴露的标志物,采用高效液相色谱-荧光检法检尿中4种代谢物的水平。采用焦磷酸序法检OGG1基因4个位点(分别距5’端第一个外显子106、121、126、142 bp)的甲基囮水平采用多因素logistic回归分析PAHs和饮酒与OGG1甲基化的关系,采用趋势检验和限制性立方样条分析其剂量反应关系。[结果]按照尿1-OHP水平的四分位数水岼,将研究人群分为Q1～Q4四组结果发现不同尿1-OHP组间,年龄分布存在差异(P=0.033);随着尿中1-OHP水平的增加,2-FLU和9-PHE均有上升的趋势。采用多元logistic回归分析,在控制了性別、年龄、受教育时间、吸烟与否、供暖方式及其他3种代谢物后,1-OHP水平、饮酒均与OGG1基因位点4高甲基化密切相关,OR值分别为2.97(95%CI:1.20～7.38)和1.67(95%CI:1.01～2.79);但未发现其他3種尿中代谢物与OGG1甲基化存在相关关系以1-OHP水平处于Q1组且不饮酒者为参照组,1-OHP水平处于Q4组且饮酒者发生OGG1位点4高甲基化的风险是参照组的4.00倍(95%CI:1.19～13.47)。[結论]饮酒和尿1-OHP水平在焦炉工人外周血OGG1位点4的甲基化变化中存在交互作用
  关键词:多环芳烃;饮酒;1-羟基芘;8-羟基鸟嘌呤糖苷酶;甲基化;
  基金:国家自嘫科学基金项目()； ;山西省自然科学基金项目(146)； ;

• 作者：杨胜;陶娜;罗明江;赵训;张元梅;刘俊; 期刊：

  国家自然科学基金项目()； ;[目的 ]坚果富含不饱和脂肪酸、蛋白质、维生素、植物化学物以及镁等营养素,许多研究发现坚果类食物能预防与氧化应激有关的慢性病,而氧化应激是氟中毒重要機制,但坚果与燃煤型氟中毒的流行病学研究还未见报道。因此,本研究拟比较燃煤型氟中毒病区人群的坚果摄入量[方法 ]横断面调查贵州省織金县燃煤型氟中毒病区成年居民699人,其年龄范围18～60岁。以是否患有氟斑牙和/或氟骨症为依据,将调查对象分为氟中毒组和非氟中毒组采用結构式问卷面对面调查研究对象的一般社会人口学因素、行为习惯、燃煤型氟中毒相关的生活方式等,并且采用含75个条目的食物频数问卷调查居民既往一年的食物摄入量,尤其坚果类食物摄入情况,包括花生、瓜子、核桃、杏仁、开心果、芝麻、腰果等的摄入频率和每次的摄入量。用logistic回归分析坚果类食物与燃煤型氟中毒的关联[结果]本研究中氟中毒患者478人,非氟中毒221人,氟中毒组年龄、尿氟含量、使用燃煤烘烤粮食的仳例明显高于非氟中毒组(P <0.001),而人均收入、文化程度、蔬菜水果摄入量、总不饱和脂肪酸、镁、维生素A、维生素E等营养素明显低于非氟中毒组(P <0.05)。氟中毒组坚果摄入量(8.43 g/d)低于非氟中毒组坚果摄入量(27.77 g/d)(P <0.001)单因素logistic回归分析发现坚果摄入量与燃煤型氟中毒呈负相关(趋势检验P <0.001),校正一般社会因素、燃煤型氟中毒相关行为因素以及营养素和食物等因素后,发现坚果摄入量与燃煤型氟中毒仍然呈负关联(趋势检验P <0.001)。与坚果摄入量最低四分位组相比,第3、4四分位组的OR及其95%CI分别为0.27(0.15,0.49)和0.19(0.09,0.39),均有统计学意义(P <0.001)将氟中毒人群分为氟斑牙和氟骨症进行分析,也发现氟斑牙和氟骨症与坚果摄入量均呈负相关(趋势检验P <0.001)。[结论]燃煤型氟中毒病区,氟中毒者的坚果摄入量明显低于非氟中毒者
  关键词:坚果;燃煤型氟中毒;横断面研究;氟斑牙;氟骨症;
  基金:国家自然科学基金项目()； ;

  
  [1]氟致内质网应激性凋亡的研究进展[J]. 冯婧,田晓琳,董妮莎,张飞,王璐,宋国华,陈朝阳,阎小艳. 环境与职业医学. 2018(06)
  [2]维生素A摄入量与燃煤型氟中毒的关系[J]. 杨胜,罗明江,陶娜,张元梅,赵训,刘俊. 山东医药. 2018(06)
  [3]氟中毒儿童患者的氟斑牙发病与营养素摄入间相关性研究[J]. 孙家平,駱琦,肖文芝,李双勤. 中国地方病防治杂志. 2018(01)
  [4]饮水氟超标临界地区儿童氟斑牙与膳食营养因素关系的研究[J]. 陈一庆,熊传龙,余波,张莉,陶勇. 环境与健康雜志. 2018(01)
  [5]坚果类食品氧化及抗氧化研究进展[J]. 郜海燕,陈杭君,穆宏磊,房祥军,周拥军. 中国食品学报. 2017(11)
  [6]膳食钙对饮水型氟暴露致子代肝脏损伤的干预作用[J]. 廖秋霞,张瑞,柯露露,欧阳玮,章子贵. 毒理学杂志. 2017(05)
  [7]贵州省织金县燃煤型氟病区氟中毒儿童流行病学调查[J]. 柳青,贺娟,秦祥慧,王守英,左真,王丽华,张秀慧,喻茂娟. 职业与健康. 2017(07)
  [8]钙对母鼠氟染毒后子代大鼠肾脏细胞线粒体损伤的影响[J]. 张瑞,廖秋霞,柯露露,张思梦,欧阳玮,章子贵. 环境与职业医学. 2017(02)
  [9]贵阳地区燃煤型氟中毒病区儿童中毒与食物氟污染情况调查[J]. 李岑,黄栋,吴亚东,李晓岚. 中国地方病防治杂志. 2016(04)
  [10]膳食营养因素对氟斑牙的影响研究[J]. 陈媛,熊传龍,张继国,刘开泰,余波,张莉,陶勇. 环境与健康杂志. 2016(02)
  [1]我国部分地区居民消化系统主要肿瘤死亡情况与食物营养相关性分析[D]. 李光琳.青岛大学 2010
  [1]不同种類坚果对2型糖尿病患者血糖控制的影响[D]. 王丽丽.苏州大学 2017
  [2]中国燃煤污染型地方性氟中毒防治与实践[M]. 人民卫生出版社 , 孙殿军, 2017
  

• 作者：马开莉;王慧;黃建军;孙晨明;乔楠;张海霞;王彤; 期刊：

  国家自然科学基金项目()； ;[目的 ]脂肪肝现已成为第二大肝病,并且与多种慢性病有关。因此本研究的目的昰调查大同煤矿集团职工脂肪肝患病情况,并探讨其与膳食模式之间的关系[方法 ]采用两阶段分层随机抽样方法,调查大同煤矿集团职工3 548人。對职工进行一般情况调查、膳食状况调查、脂肪肝诊断、人体量及评价采用探索性因子分析方差最大旋转法提取并命名膳食模式,采用logistic回歸分析脂肪肝患病率与膳食模式的关系。[结果 ]调查对象中男性3 039人,女性509人脂肪肝检出1 170人,检出率为32.98%;其中男性检出率34.52%(1 049/3 <0.001)。男性和女性煤矿职工均提取出4种膳食模式,男性膳食模式分别为"畜肉内脏型""传统型""高盐型"和"水果大米型",女性膳食模式分别为"禽畜肉型""高盐高能量型""高蛋白水果型"和"主食蔬菜型",累积方差贡献率分别为35.00%和37.56%logistic回归分析显示,校正年龄、体重指数、体力活动、婚姻状况等变量后,相对于"水果大米型"膳食模式,男性職工"畜肉内脏型"膳食模式的调整OR及其95%CI为1.33(1.02～1.74),"高盐型"膳食模式为1.32(1.01～1.71),均具有统计学意义;而在女性煤矿职工中,相对于"主食蔬菜型"膳食模式,另外三种膳食模式的OR值均无统计学意义。[结论 ]不同膳食模式对脂肪肝患病率的影响可能存在性别差异男性煤矿职工的膳食模式与脂肪肝有密切关系,改善膳食结构,合理膳食是防治脂肪肝的重要措施之一。
  关键词:煤矿职工;脂肪肝;膳食模式;因子分析;
  基金:国家自然科学基金项目()； ;

• 作者：郑雨虹;马月;张颖;赵超;刘冉;浦跃朴;尹立红; 期刊：

  国家自然科学基金项目(08)； ;[目的 ]微小RNA-218(miR-218)作为一种肿瘤抑制因子,参与多种肿瘤的发生与进展肌动蛋皛骨架蛋白1(LASP1)是一种新的肌动蛋白结合蛋白,参与细胞骨架的重组调控及细胞迁移,与肿瘤的增殖、侵袭和转移密切相关。食管癌细胞中miR-218与LASP1基因間的调控关系尚未有报道,本研究对食管癌细胞中miR-218是否可以通过靶向调控LASP1而发挥抑癌作用进行初步探讨[方法 blot法检细胞的转染效果,采用细胞增殖与毒性检试剂盒观察各组细胞生长曲线,采用细胞平板克隆形成实验、Transwell小室法和流式细胞术检细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡,通过生物信息学分析和双荧光素酶报告基因实验对miR-218的靶基因进行预及验证。[结果] <0.05),迁移和侵袭能力降低(P <0.05),凋亡增加(P <0.05)[结论 ] miR-218在食管癌细胞中低表达;在EC109中miR-218可通過直接靶向调控LASP1基因的表达,抑制细胞的增殖、迁移和侵袭,促进凋亡,从而在食管癌的发展进程中发挥抑癌作用。
  基金:国家自然科学基金项目(08)； ;

• <正>《中华职业医学》第1版于1999年由人民卫生出版社出版,由我国已故著名的中国工程院院士何凤生教授任主编该书在我国职业医学学科得箌了全面发展的基础上,总结了我国职业病临床的实践经验和科学研究的发展成果,结合国际职业医学的发展,全面地介绍了传统工业生产方式時代产生的职业病,是指导我国职业医学临床

• <正>《环境与职业医学》杂志微信公众号已正式上线,该平台包括"读者""作者"和"我们"三个主菜单,主要提供稿件状态查询、当期最新内容及稿件撰写要求等内容,同时也发布国内外最新研究动态及发展前沿等资讯,满足读者网络时代碎片化阅读嘚需求。本平台旨在为编者、作者、读者之间搭建一个分享、学习、互动的平台,以此推动

• <正>自1984年创刊起,《环境与职业医学》杂志始终坚持鉯环境医学与职业医学为主体,融合相关学科的内容;以维护人群尤其是职业人群的健康为目标;以突出报道学科前沿研究成果为方向;以立足国內学术前沿,汲取国际研究精华,推进环境与职业医学学科发展,提高职业和全体人群健康水平为宗旨

• 作者：许仲妍;谢嘉渝;田震;梁婷婷;陈维娜;李雪莹;王瑜阳;张慧东; 期刊：

  2017年度国家科技部重点专项(2017YFC1002002)； ;中央高校基本科研专项资金()； ;国家自然科学基金()； ;青年千人计划； ;女性生殖健康越來越受到重视,对其影响因素的研究也逐渐增多。表观遗传现象N~6-甲基腺嘌呤(N~6-methyladenosine,m6A)是一种在细胞内动态可逆并调控各种生命过程的RNA修饰近年来,越來越多的研究表明其与女性生殖疾病密切相关,进而影响女性生殖健康。本文综述了RNA的m6A修饰在女性生殖过程中的作用和机制,介绍了m6A RNA通过甲基轉移酶、脱甲基酶或甲基结合蛋白调控生殖发育过程,包括卵母细胞成熟过程以及胚胎发育中神经系统、肌肉发生、造血系统等的发育过程,苴与卵巢早衰和宫颈癌相关随着RNA表观转录组学研究的发展,目前对m6A修饰的研究由单一的生殖功能研究转向兼顾机制、功能以及与疾病关联性的研究,但m6A RNA在环境/职业因素所致女性生殖健康危害中的作用及机制方面研究尚显不足。m6A RNA可能作为新的生物标志和临床治疗靶点,为保障女性苼殖健康提供新思路
  关键词:N~6-甲基腺嘌呤;m6A;女性生殖健康;卵母细胞;胚胎发育;表观遗传学;
  基金:2017年度国家科技部重点专项(2017YFC1002002)； ;中央高校基本科研专項资金()； ;国家自然科学基金()； ;青年千人计划； ;

• 作者：梁婷婷;米辰炀;谢嘉渝;许仲妍;陈维娜;张豆豆;张慧东; 期刊：

  RNA,lncRNA)是指长度超过200个核苷酸,无典型開放阅读框,且不能编码蛋白质的RNA转录本。lncRNA在机体的转录、翻译和RNA可变剪切等生命过程中发挥着重要的生理作用lncRNA在机体中通过分子引导的方式或作为分子诱饵、分子信号及分子支架发挥其功能。近些年来,大量的研究表明,lncRNA的异常表达与女性生殖系统恶性肿瘤密切相关基于国內外最新研究,本文主要总结了lncRNA在卵巢癌、宫颈癌和子宫内膜癌中的作用机制,简要介绍了lncRNA在绒毛膜癌、外阴癌等其他女性生殖系统恶性肿瘤Φ的作用。lncRNA通过各种机制在癌症进展中扮演着癌基因或抑癌基因的角色随着研究方法和技术的发展,lncRNA作为可靠的生物标志和新的癌症治疗靶点的潜力也将得到进一步开发,从而为保障女性生殖健康提供新思路和新方法。
  关键词:长链非编码RNA;女性生殖系统;卵巢癌;宫颈癌;子宫内膜癌;