你好,想问计算r谷氨酸转肽酶的r-COOH三分之二被解离时的溶液PH pka是4.25

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氨基酸、多肽链和蛋白质的等电点及其相关计算(解题示例)

我在今年年初回答别人的提问以及以前的资料汇编,因为我也有教学工作。

    本帖部分例题内容摘自:网上的发的王镜岩 主编,生物化学(上),高教出版社,2002,第三版的课后习题解答。谢谢解答者!我大致看了一下,把有错的地方给改过来了,连同楼上我摘录的张来群 等,生物化学习题集,科学出版社,2002,第一章的Lys-Lys-Lys的等电点计算,还有我自己写的“酒石酸缓冲溶液的配置(附录缓冲溶液的配制方法小结)”应对生物化学考研试题应该足够了。


(一) 氨基酸解离的pH计算的解题方法:
    1.题设中是哪个基团解离就用那个基团的pK,其他深的东西这里不讲,讲多了反而乱。
    2.如果分不清共轭酸碱,那么更简单的规则:[共轭碱]/[共轭酸]=[质子受体]/[质子供体]=[氢离子离去后剩下的离子或者分子]/[带有氢离子的离子或为失去质子的分子],请看例1的说明,注意分子和分母的对象(质子受体与质子供体)必须是一对共轭酸碱,也就是说两者除了相差1个或多个氢离子外其余部分没有两样!最简单的规则:缺质子的在分子,或者缺质子的在上面。

例2.酒石酸缓冲溶液的配置(附录缓冲溶液的配制方法小结)

“酒石酸钠的分子量”=所要的酒石酸钠的质量。    酒石酸是液体,我们用在1mol 溶质中: 酒石酸的物质的量(摩尔数)-----也就是:1/30mol/“酒石酸溶液的摩尔浓度”=酒石酸所需的体积。“酒石酸溶液的摩尔浓度"是指你们实验室的现货酒石酸溶液的摩尔浓度,当然要比最终缓冲溶液浓度大,不然还要先浓缩。    这样,1mol溶质中酒石酸钠和酒石酸就凑齐了,先把两者都放进1L的烧杯中,然后向里注蒸馏水直到总体积到达1L或略少,搅拌均匀,测定PH,可往里面加极少量的酒石酸钠或酒石酸把PH值跳到4.5. 如此,你就有了1L的1mol/L的PH=4.5酒石酸缓冲溶液,然后再稀释到250mmol/L,稀释过程不影响pH值。除非无限稀释,因为那时就要考虑的水的pKa了。

    当然,按250mmol溶质算酒石酸钠和酒石酸的用量,然后加蒸馏水定容至1L,不再稀释也可以。

氨基酸和多肽的等电点(isoelectric point)的计算方法:

例4. 将含有天冬氨酸(pI=2.98)、甘氨酸(pI=5.97)、亮氨酸(pI=6.53)和赖氨酸(pI=5.98)的柠檬酸缓冲液,加到预先同样缓冲液平衡过的强阳离交换树脂中,随后用爱缓冲液析脱此柱,并分别收集洗出液,这5种氨基酸将按什么次序洗脱下来?[Asp, Thr, Gly, Leu, Lys]


解:在pH3左右,氨基酸与阳离子交换树脂之间的静电吸引的大小次序是减刑氨基酸(A2+)>中性氨基酸(A+)>酸性氨基酸(A0)。因此氨基酸的洗出顺序大体上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是碱性氨基酸,由于氨基酸和树脂之间还存在疏水相互作用,所以其洗脱顺序为:Asp, Thr, Gly, Leu, Lys。(这题直接从网上摘来,我看没有错也就编辑,谢谢解答者)

例5。根据氨基酸的pKa值(请自行查阅生物化学教材),计算下列氨基酸的pI值:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。[pI:6.02;5.02;3.22;10.76]

例6.三个lys连在一起,即三肽Lys-Lys-Lys的等电点如何计算?解:这题不是我原创的,是张来群

例8.见:王镜岩 主编,生物化学(上),高教出版社,2002,第三版,166页。

例9.写出混合氨基酸对于阳离子交换的洗脱规律。写出强酸性阳离子交换柱上Asp,His,Gly,Leu,Thr的洗脱顺序(先下的列在前面)。

例15.有一种多肽,其侧链上羧基30个(pK=4.3),嘧唑基有10个(pK=7),-N+H3(pK=10),设C末端-羧基pK=3.5,N-末端氨基pK=9.5,计算此多肽的pI。    解:要计算多肽的等电点,首先应该找到静电荷为零的分子状态。在此多肽中最多可以带有(30+1)个单位负电荷,而正电荷最多只有(15+10+1)个,相差了5个电荷。要想让正负电荷数相等,只能让30个羧基(侧链-COOHpK=4.3)少带5个负电荷(-COOHpK=3.5,它比侧链-COOH易于解离,难于接受质子),即在30个侧链-COOH中有25个处于解离状态(-COO-),5个不解离(-COOH)。

例16. 计算以下肽和蛋白质的等电点:

例18.请问已知氨基酸序列的情况下,怎么计算等电点?还需要了解其他什么信息吗?因为需要做离子交换,还在摸条件,却不知道蛋白的PI值?

解:freecell:有许多生物软件和网上软件都可计算出pI.例如expasy服务器就提供如此服务,把氨基酸序列输入就可以看到了:   


  蛋白质的等电点可以用专业分子生物学软件估算和用等点聚焦实验加以测定,可以参考:刘旭光、张杰,分子生物学软件应用,北京大学医学出版社,2007,第152-154页,DNAstar,ANTHEPROT等软件都可以对于蛋白质进行滴定曲线和等电点的理论预测。

例19.指出用电泳技术分离下列物质,pH是多少时最合适?


解:电泳分离技术是根据物质带电荷的多少达到分离的目的。待分离的物质所带电荷的差异越大分离效果就越好,所以应取两者pI的中间值,带正电荷的粒子电泳时向负极移动,带负电荷的粒子电泳时向正极移动。

例20.将固体氨基酸溶于pH7的水中所得的氨基酸溶液,有的pH大于7,有的小于7,这种现象说明什么? 答:氨基酸既带有氨基也有羧基,是两性电解质。当固体的氨基酸溶于纯水中时,酸性基团解离出质子使溶液变为酸性,碱性基团接受质子使溶液变为碱性。  在20种蛋白质中的常见氨基酸中,一氨基一羧基的氨基酸溶于水后溶液基本为中性,一氨基二羧基的氨基酸溶于水后溶液pH小于7为酸性,二氨基一羧基的氨基酸,如Lys、Arg溶于水后溶液pH大于7为碱性。

例21.某氨基酸的水溶液pH值为6.0,问此氨基酸的等电点是大于6,等于6,还是小于6?


   答:该氨基酸水溶液pH值为6.0,说明该氨基酸羧基的解离程度大于氨基,要使氨基酸上的羧基的解离程度与氨基的解离程度相同,只有加酸抑制其水解,故该氨基酸的pI小于6。
附录:等电点计算参考:

等电点:如果调节溶液的PH值使得其中的氨基酸呈电中性,我们把这个PH值称为氨基酸的等电点:PI。PI是氨基酸的重要常数之一,它的意义在于,物质在PI处的溶解度最小,是分离纯化物质的重要手段。等电点的计算:对于所有的R基团不解离的氨基酸而言(即解离只发生在α-羧基和α-氨基上),计算起来非常简单:PI=(PK1’+PK2’)/2若是碰到R基团也解离的,氨基酸就有了多级解离,这个公式就不好用了,比如Lys、Glu、Cys等。aa 12.48(胍基)在这种情况下可以按下面的步骤来计算: 由PK’值判断解离顺序,总是PK1’ 按照解离顺序正确写出解离方程式:简式,注意解离基团的正确写法。 找出呈电中性的物质,其左右PK’值的平均值就是氨基酸的等电点:PI=(PK左’+PK右’)/2以Lys为例:在黑板上用简式演示等电点的测定:等电聚焦法:这是一种特殊的电泳,其载体上铺有连续的PH梯度的缓冲液,然后将氨基酸点样,只要该处的PH与氨基酸的PI不同,则氨基酸就会带电,PH值>PI时,aa带-电;PH值    

氨基酸、多肽链和蛋白质的等电点及其相关计算(解题示例)

我在今年年初回答别人的提问以及以前的资料汇编,因为我也有教学工作。

    本帖部分例题内容摘自:网上的发的王镜岩 主编,生物化学(上),高教出版社,2002,第三版的课后习题解答。谢谢解答者!我大致看了一下,把有错的地方给改过来了,连同楼上我摘录的张来群 等,生物化学习题集,科学出版社,2002,第一章的Lys-Lys-Lys的等电点计算,还有我自己写的“酒石酸缓冲溶液的配置(附录缓冲溶液的配制方法小结)”应对生物化学考研试题应该足够了。


(一) 氨基酸解离的pH计算的解题方法:
    1.题设中是哪个基团解离就用那个基团的pK,其他深的东西这里不讲,讲多了反而乱。
    2.如果分不清共轭酸碱,那么更简单的规则:[共轭碱]/[共轭酸]=[质子受体]/[质子供体]=[氢离子离去后剩下的离子或者分子]/[带有氢离子的离子或为失去质子的分子],请看例1的说明,注意分子和分母的对象(质子受体与质子供体)必须是一对共轭酸碱,也就是说两者除了相差1个或多个氢离子外其余部分没有两样!最简单的规则:缺质子的在分子,或者缺质子的在上面。

例2.酒石酸缓冲溶液的配置(附录缓冲溶液的配制方法小结)

“酒石酸钠的分子量”=所要的酒石酸钠的质量。    酒石酸是液体,我们用在1mol 溶质中: 酒石酸的物质的量(摩尔数)-----也就是:1/30mol/“酒石酸溶液的摩尔浓度”=酒石酸所需的体积。“酒石酸溶液的摩尔浓度"是指你们实验室的现货酒石酸溶液的摩尔浓度,当然要比最终缓冲溶液浓度大,不然还要先浓缩。    这样,1mol溶质中酒石酸钠和酒石酸就凑齐了,先把两者都放进1L的烧杯中,然后向里注蒸馏水直到总体积到达1L或略少,搅拌均匀,测定PH,可往里面加极少量的酒石酸钠或酒石酸把PH值跳到4.5. 如此,你就有了1L的1mol/L的PH=4.5酒石酸缓冲溶液,然后再稀释到250mmol/L,稀释过程不影响pH值。除非无限稀释,因为那时就要考虑的水的pKa了。

    当然,按250mmol溶质算酒石酸钠和酒石酸的用量,然后加蒸馏水定容至1L,不再稀释也可以。

氨基酸和多肽的等电点(isoelectric point)的计算方法:

例4. 将含有天冬氨酸(pI=2.98)、甘氨酸(pI=5.97)、亮氨酸(pI=6.53)和赖氨酸(pI=5.98)的柠檬酸缓冲液,加到预先同样缓冲液平衡过的强阳离交换树脂中,随后用爱缓冲液析脱此柱,并分别收集洗出液,这5种氨基酸将按什么次序洗脱下来?[Asp, Thr, Gly, Leu, Lys]


解:在pH3左右,氨基酸与阳离子交换树脂之间的静电吸引的大小次序是减刑氨基酸(A2+)>中性氨基酸(A+)>酸性氨基酸(A0)。因此氨基酸的洗出顺序大体上是酸性氨基酸、中性氨基酸,最后是碱性氨基酸,由于氨基酸和树脂之间还存在疏水相互作用,所以其洗脱顺序为:Asp, Thr, Gly, Leu, Lys。(这题直接从网上摘来,我看没有错也就编辑,谢谢解答者)

例5。根据氨基酸的pKa值(请自行查阅生物化学教材),计算下列氨基酸的pI值:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。[pI:6.02;5.02;3.22;10.76]

例6.三个lys连在一起,即三肽Lys-Lys-Lys的等电点如何计算?解:这题不是我原创的,是张来群

例8.见:王镜岩 主编,生物化学(上),高教出版社,2002,第三版,166页。

例9.写出混合氨基酸对于阳离子交换的洗脱规律。写出强酸性阳离子交换柱上Asp,His,Gly,Leu,Thr的洗脱顺序(先下的列在前面)。

例15.有一种多肽,其侧链上羧基30个(pK=4.3),嘧唑基有10个(pK=7),-N+H3(pK=10),设C末端-羧基pK=3.5,N-末端氨基pK=9.5,计算此多肽的pI。    解:要计算多肽的等电点,首先应该找到静电荷为零的分子状态。在此多肽中最多可以带有(30+1)个单位负电荷,而正电荷最多只有(15+10+1)个,相差了5个电荷。要想让正负电荷数相等,只能让30个羧基(侧链-COOHpK=4.3)少带5个负电荷(-COOHpK=3.5,它比侧链-COOH易于解离,难于接受质子),即在30个侧链-COOH中有25个处于解离状态(-COO-),5个不解离(-COOH)。

例16. 计算以下肽和蛋白质的等电点:

例18.请问已知氨基酸序列的情况下,怎么计算等电点?还需要了解其他什么信息吗?因为需要做离子交换,还在摸条件,却不知道蛋白的PI值?

解:freecell:有许多生物软件和网上软件都可计算出pI.例如expasy服务器就提供如此服务,把氨基酸序列输入就可以看到了:   


  蛋白质的等电点可以用专业分子生物学软件估算和用等点聚焦实验加以测定,可以参考:刘旭光、张杰,分子生物学软件应用,北京大学医学出版社,2007,第152-154页,DNAstar,ANTHEPROT等软件都可以对于蛋白质进行滴定曲线和等电点的理论预测。

例19.指出用电泳技术分离下列物质,pH是多少时最合适?


解:电泳分离技术是根据物质带电荷的多少达到分离的目的。待分离的物质所带电荷的差异越大分离效果就越好,所以应取两者pI的中间值,带正电荷的粒子电泳时向负极移动,带负电荷的粒子电泳时向正极移动。

例20.将固体氨基酸溶于pH7的水中所得的氨基酸溶液,有的pH大于7,有的小于7,这种现象说明什么? 答:氨基酸既带有氨基也有羧基,是两性电解质。当固体的氨基酸溶于纯水中时,酸性基团解离出质子使溶液变为酸性,碱性基团接受质子使溶液变为碱性。  在20种蛋白质中的常见氨基酸中,一氨基一羧基的氨基酸溶于水后溶液基本为中性,一氨基二羧基的氨基酸溶于水后溶液pH小于7为酸性,二氨基一羧基的氨基酸,如Lys、Arg溶于水后溶液pH大于7为碱性。

例21.某氨基酸的水溶液pH值为6.0,问此氨基酸的等电点是大于6,等于6,还是小于6?


   答:该氨基酸水溶液pH值为6.0,说明该氨基酸羧基的解离程度大于氨基,要使氨基酸上的羧基的解离程度与氨基的解离程度相同,只有加酸抑制其水解,故该氨基酸的pI小于6。
附录:等电点计算参考:

等电点:如果调节溶液的PH值使得其中的氨基酸呈电中性,我们把这个PH值称为氨基酸的等电点:PI。PI是氨基酸的重要常数之一,它的意义在于,物质在PI处的溶解度最小,是分离纯化物质的重要手段。等电点的计算:对于所有的R基团不解离的氨基酸而言(即解离只发生在α-羧基和α-氨基上),计算起来非常简单:PI=(PK1’+PK2’)/2若是碰到R基团也解离的,氨基酸就有了多级解离,这个公式就不好用了,比如Lys、Glu、Cys等。aa 12.48(胍基)在这种情况下可以按下面的步骤来计算: 由PK’值判断解离顺序,总是PK1’ 按照解离顺序正确写出解离方程式:简式,注意解离基团的正确写法。 找出呈电中性的物质,其左右PK’值的平均值就是氨基酸的等电点:PI=(PK左’+PK右’)/2以Lys为例:在黑板上用简式演示等电点的测定:等电聚焦法:这是一种特殊的电泳,其载体上铺有连续的PH梯度的缓冲液,然后将氨基酸点样,只要该处的PH与氨基酸的PI不同,则氨基酸就会带电,PH值>PI时,aa带-电;PH值    

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氨基酸大多有三个电解离常数,这是由其结构决定的。

记住以后提问要悬赏,没悬赏,你让人家怎么给你回啊????!!!

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