怎样查找获取目的基因的方法上游基因

在NCBI上查找目的基因时,怎么知道基因名称或基因_百度知道
在NCBI上查找目的基因时,怎么知道基因名称或基因
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先搜到目的基因,然后display里面选genbank 里面会给基因编号 完全说明的最下面还会有mRNA和蛋白编号在NCBI上查找目的基因时,怎么知道基因名称或基因
hiphotos.baidu.com/zhidao/wh%3D600%2C800/sign=b0a19d8cb568c0303caaeb3/67dde5abbb7d1a28792.com/zhidao/pic/item/67dde5abbb7d1a28792.jpg" target="_blank" title="点击查看大图" class="ikqb_img_alink"><img class="ikqb_img" src="http.jpg" esrc="http.hiphotos.baidu.com/zhidao/wh%3D450%2C600/sign=f5da2f9d898ba61edfbbc02b380cd7912397dde5abbb7d1a28792://e://e.baidu。<a href="http://e.hiphotos搜索RS好就有目的基因的名称了
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心得分享:如何查找特定基因序列
心得分享:如何查找特定基因序列
来源:互联网
点击次数:22040
如何查找特定基因序列的心得与大家共享,下面以小鼠EDNRB基因为例子说明:
查找一个基因的启动子之前,最好是要对这个基因做一个初步的了解,了解方法为:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/上面查找ednrb
注意:在research下面选择 Gene 在for后面输入ednrb
这个是查找结果,由于很多哺乳类动物都有该基因,查找结果显示了很多五种的ednrb基因,我们选择其中的Mus musculus 这个是我们要找的小鼠种类,请大家正确选择自己目标基因的动物种类,Rattus norvegicus是大鼠的学名,Mus musculus是小鼠的学名,由于我的目标是小数的ednrb基因,故选择Mus musculus。
3: 对Official Symbol Ednrb and Name: endothelin receptor type B [Mus musculus] Other Aliases: AU022549, ET-B, ET&B&, ETb, Sox10m1, s Other Designations: piebald Chromosome: 14; Location: 14 51.0 cM Annotation: Chromosome 14, NC_ (.., complement) GeneID: 13618 解释:Official Symbol Ednrb and Name 这个是官方对这个基因的全称,也就是内皮素受体B 这个是该基因编码的蛋白质名称 Other Aliases 该基因的别名 Chromosome: 14; Location: 14 51.0 cM 说明该基因位于第14条染色体上面 Annotation: Chromosome 14, NC_ (.., complement) GeneID: 13618 这个说明基因的碱基分布是到.
该基因的具体信息
下面这个图片是上个图片的下半部分
以上部分是找到对该基因的基本信息,在最下面Reference assembly (C57BL/6J)上面找到基因具体序列的链接,点击其中的GenBank, ednrb基因碱基的排列就出来了,这里说明 一下,genbank上面给的序列都是与相应mRNA互补的序列,也就是模板链的序列,也就是-(minus strand) 上面的C57BL/6J是得出该序列的小鼠品系,如果大家要做相关实验的话 最好是选择该品系的小鼠或者相应的细胞。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?val=NC_&from=&to=&strand=2&dopt=gb 上面是该基因的信息和碱基序列链接,上面有碱基的序列,mRNA 的序列。
本文作者系丁香园站友,zhangdagou 原帖链接:
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DXY All Rights Reserved.如何在pubmed上找到目标基因序列_百度知道
如何在pubmed上找到目标基因序列
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这样查出来的一般是mRNA序列 如果在下拉框中选Gene,则查出来的一般是该基因的其他信息,这样还是会出来一大堆摘要,仔细看一下描述,找到你需要的,里面有全基因的序列,点进去。 注意,结果一般会有好多,选中你要的种属。输入你要查找的基因名称,最好再输入种属缩小下范围.推荐你看看张成岗和贺福初编的《生物信息学方法与实践》,虽然是02年编的,我觉得还是不错的,而且也不厚,看完后相信对你的研究工作也会有帮助的.在具体的没法和你说了,你找一本生物信息学方面的书,里面都有讲的,你自己好好看看如何在pubmed上找到目标基因序列打开Pubmed后,在最顶上的下拉框中选中nucleotide, 然后输入基因的名称
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求助:如何找到靶基因上游的转录因子
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这个帖子发布于3年零318天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
问题已解决悬赏丁当:2
路过的生物信息的朋友们,请帮忙分享下你的建议,我现在有一堆靶基因,我想找到他们上游的转录因子,我应该怎么做
(8046.65k)
不知道邀请谁?试试他们
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8兆的基因也太多了吧 而且还要丁当。。。
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你有多少个靶基因啊先把他们的promter 取出来
扫下 motif
看有没有 已知的TF
binding的 motif
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最后我去掉重复就剩下2440个 靶基因
先把他们的启动子取出来有什么好方法取吗??我现在的思路只有一个一个的取啊我不知道有没有什么方法让我很方便的把靶基因的上游转录因子找到
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关于丁香园如何查找基因下游通路_中华文本库
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