glide score和mark的区别结合自由能的区别

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2017-06-09 10:52 标签： picasso和glide的区别
"The Honeymoon Glide " by W. Raymond Walker and Jos. H McKeon
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Collection
Vocal Popular
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Physical Description
1 score (6 p.) : ill. ; 31 cm.
Harry Von Tilzer Music Pub. Co
Publication Place
Recommended Citation
Walker, W. Raymond and McKeon, Jos. H, "The Honeymoon Glide" (1910). Vocal Popular Sheet Music Collection. Score 599.http://digitalcommons.library.umaine.edu/mmb-vp/599
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基于分子对接和QSAR方法预测B-Raf Ⅱ型抑制剂活性.pdf 16页
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基于分子对接和QSAR方法预测B-Raf Ⅱ型抑制剂活性
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--------------------------Page1------------------------------物理化学学~E(wuliHuaxueXuebaoNovemberActaP．一Chim．Sin．)，l[Article]doi：10．3866／PKU．WHXBWWW．whxb．pku．edu．cn基于分子对接和QSAR方法预测B．Rafll型抑制剂活性刘海春卢帅冉挺’张艳敏’徐金星’熊潇徐安阳’陆涛，陈亚东(中国药科大学理学院，南京211198；。中国药科大学，天然药物活性组分与药效国家重点实验室，南京210009)摘要：B—Ra馓酶在促分裂素原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路中起着重要作用，已被确定为癌症治疗非常有吸引力的靶标．新型高效B．Raf抑制剂的开发成为癌症治疗的一个热门研究领域．本文以结构多样的B．RafJI型抑制剂为研究对象，联合应用分子对接和定量构效关系(QSAR)模型研究其定量构效关系去探讨抑制活性的起源．两个主题作为研究重点：生物活性构象和描述符．首先对分子对接方法(Glide、Gold、LigandFit、Cdocker和Libdock)进行准确性评价，后将研究的对象分子对接到B．Raf活性位点并获得生物活性构象．基于准确的对接结果，计算得到16个打分评价函数~1121个能量描述符，以此构建定量构效关系模型．QSAR结果表明模型具有高度精确的拟合和强的预测能力(模型M1：=0．852，r南v)=0．790，r=0．864；模型M2：=0．738，r)=0．812，r=o．8605)．同时探讨了对抑制活Si有重要影响的描述符，结果表明打分评价函数(GScore，．ECD，DockScore，PMF)与能量描述符(S(hbext)，DE(int)，Emode1)对抑制活性影响非常大．通过虚拟筛选和QSAR模型理论预测，一些新的具有潜在抑制活性的化合物作为B-RafI1型抑制剂被获得．上述信息对于进一步设计新颖高效的B．RafII型抑制剂提供了有用的指导．关键词：B．Rafll型抑制剂：分子对接：打分评价函数：对接能量描述符：定量构效关系模型中图分类号：O641AccurateActivityPredictionsofB—RafTypeIIInhibitorsv／aMolecularDockingandQSARMethodsLIUHa1．Chun’LUShuai’RANTing’ZHANGYan-Min’XUJin-Xing’XIONGXiao’XUAn—Yang’LUTao’’’CHENYa-Dong’'rSchoolofBasicScience,ChinaPharmaceuticalUniversity,Nanjing211198,PR．China；StateKeyLaboratoryofNaturalMedcines，ChinaPharmaceuticalUniversiyt,Nanjing210009,P．R．China)Abstract：B-Rafkinaseplaysanimportantroleinthemitogen—activatedproteinkinase(MAPK)signalingtransmissionpathwayandhasbeenidentifiedasanattractivetargetforcancertherapy．TheexploitationofRovelandefficientB-Rafinhibitorshasbecomeahotresearchtopic．Inthisstudy。weinvestigatedquantitativestructure-activityrelationship(QSAR)toprobetheoriginsoftheinhibitoryactivitiesofB-RafTypellinhibitors．WeusedstructurallydiverseB．RafTypelIinhibitorsandanintegrateddockingandQSARextendedmethod．Wefocusedmainlyontwothemes：bioactiveconformationsanddescriptors．First，variousmoleculardockingmethodsfGlide，Gold，LigandFit，Cdocker，andLibdock)wereevaluated，andthenallmoleculesweredockedjntotheB．Rafactivesitetoobtainthebioactiveconformations
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