目的基因片段是100内参基因tublin的大小片段大小是500可以做吗

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2017-05-30 07:04 标签： 目的基因
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综述?Ｒｅｖｉｅｗ。Ｐａｐｅｒｓ。２０１３年第４９卷第１１期。实时荧光定量ＰＣＲ内参基因的选择。董恩妮１，梁。青１，李利１，王林杰１，仲涛１，王永２，张红平ｐ。６１０２２５）。（１．四川农业大学动物遗传育种研究所，四川雅安。摘。６２５０１４；２．西南民族大学，四川成都。要：实时荧光定量ＰＣＲ（ｑＲＴ—ＰＣＲ）作为一种检测ｍＲＮＡ的敏感方法已被广泛应用于基因的表达分析。在利。用ｑＲＴ—ＰＣＲ技术检测..
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实时荧光定量PCR内参基因的选择
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1.75亿学生的选择
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1.75亿学生的选择
您好,我在进行DNA序列比对碰到一些问题,序列比对的结果都是Unclutured,这样的结果能行吗测了500条,片段长度为150bp左右,在NCBI上blast的结果都为Unclutured,我好担心这样的结果不能用啊.感激不尽!
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1.75亿学生的选择
你是进行宏基因组PCR吗?如果是的话就没问题了,因为无法确定该基因的来源物种.如果不是的话结果就是不能用的,因为没有确切的结果,不够严谨和权威.
不是啊，我是将PCR产物进行TA克隆测序，得到的序列在NCBI上比对，比对的结果都为Unclutured，如其中的一个结果为Uncultured Methanosaeta sp. ，这样的结果能用吗？
你是进行菌种鉴定还是目的基因的扩增？
NCBI上的比对结果是有好几十个的，总有几个是已知的吧？
一般菌种鉴定和后续的进化树构建是要求比对结果要有明确的名称的，如Amycolatopsis decaplanina、Amycolatopsis orientalis；而Amycolatopsis sp.这类是不行的。
我是想根据测出的序列，知道它属于什么菌种，这种应该算菌种鉴定吧。NCBI上比对得到的结果都是Uncultured，如图，而且测出来的片段比理论上的少了30bp左右，我现在越比对心里越担心做出来的东西不能用，那就惨了。麻烦您帮我分析分析。谢谢了！
你测的是原核微生物的16S部分序列，从比对结果来看，那么多条结果都是100%的相似，无法判定，可见你选择的目的片段并不合适。
关于扩增原核微生物的16S部分序列，我之前有做过，不过我扩增的那个片段大小为500bp，所用的引物为27f和519r。有时间的话可以试下。
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