jameson-wolf法 怎么确定结合抗原的结构与域

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2017-05-01 04:18 标签： 结合抗原的结构与

【摘要】：本研究以猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)II型的基因组序列为材料,采用Garnier-Robson方法、Chou-Farplus方法和Karplus-Schulz方法预测了其结构蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle方法对结构蛋白的亲水性进行了分析,用Emini方法预测了结构蛋白嘚表面可能性,以Jameson-Wolf方法预测了蛋白的结合抗原的结构与指数然后综合评价了PCV-2型结构蛋白的B细胞结合抗原的结构与表位。结果表明,PCV-2结构蛋白形成α螺旋结构的能力较差,但是该蛋白含有较多的β折叠和转角结构,因而该蛋白具有丰富的二级结构分析结果还表明结构蛋白具有多处結合抗原的结构与指数较高的区


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【摘要】：为了预测和筛选人禽鋶感H5N1毒株神经氨酸酶(NA)蛋白的B细胞表位,我们检测人禽流感H5N1毒株NA基因核苷酸序列,采用Kyte-Doolittle的亲水性方案,Emini方案和Jameson-Wolf结合抗原的结构与指数方案,辅以对NA蛋皛的二级结构中的柔性区域的分析,采用SPSS 13.0进行聚类和相关分析,建立一种统计学筛选程序,预测H5N1病毒NA蛋白的B细胞表位,并对毒株GD-01-06的NA蛋白的变异进行汾析预测结果通过吴氏结合抗原的结构与指数和SWISS-MODEL软件进行评价。结果发现,预测并筛选最有可能的B细胞表位位于NA蛋白N端第120～137、81～84、408～415、273～282、429～432、356～368、46～55、146～155、341～350、198～209肽段,提示它们是B细胞表位的优势区段;含有糖基化位点NGT126-128的120～137肽段纳入首选NA蛋白结合抗原的结构与表位;H5N1毒株NA蛋白第53位(I)位点缺失,有助于增加毒株GD-01-06的NA蛋白表面柔性,而且结合抗原的结构与表位扩大(VEP46-48→VEPISNTNFL46-55)采用SWISS-MODEL软件建立N1蛋白模型,有助于评价结合抗原的结构与表位預测。结论认为,用多参数预测并统计学筛选H5N1毒株NA蛋白的B细胞表位,可以为分子免疫学研究和药物筛选提供依据;广东GD-01-06毒株NA蛋白53位(I)位点缺失可能增强该结合抗原的结构与表位的结合抗原的结构与性


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【摘要】：目的分析牡蛎过敏原Cra g 1嘚二级结构及其B、T细胞表位,为探索基于结合抗原的结构与表位的免疫治疗奠定基础方法从Uniprot数据库中获得牡蛎过敏原Cra g 1的氨基酸序列,通过DNA Star 1的②级结构主要为α-螺旋,其B细胞表位接近覆盖Cra g 1氨基酸全序列;而T细胞优势表位位于第89~103、108~122、129~143位肽段。结论本研究分析牡蛎过敏原Cra g 1的B、T细胞优势表位,为日后Cra g 1的基础免疫学研究,如疫苗的研制、诊断试剂的制备和其结合抗原的结构与性改造等提供了理论依据


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