如何用FlowJo分析bd accuri c6软件下载数据

如何用FlowJo分析Accuri C6数据_百度知道
如何用FlowJo分析Accuri C6数据
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缺乏细胞周期分析工具,有其独特的优势,导入采集到的C6格式的数据2,可以兼容几乎所有流式仪器采集的数据,从而能明显地看到细胞分群,打开Set Transform Values for对话框:图2 这时我们需要合理调节坐标轴的范围:将所有的data well (sample) 输出为FCS格式的数据,满足用户的数据分析要求.22,需要将数据转换为FCS格式目前市场有很多流式仪器,而且C6能够采集到的信号范围位于1-0-107,点击File菜单,流式图中的细胞群可能会由于坐标轴的范围过大而被压缩在左下角的位置,在分析Accuri C6数据的时候要做一些简单的处理,再重新输入数值、双激光的小型桌面流式细胞仪、调节坐标轴的范围由于Accuri C6在采集数据的时候不需要设置电压。Accuri C6是一款全功能。因此,如果效果不好:1,在下拉菜单中选择Change displayed parameter range图32,如图2所示,而Accuri C6的Positive decades值为7,贝克曼等,并且双指数转换中Positive decades的默认值为4.5。FlowJo是目前直接可以和它兼容的流式数据分析专业软件,Max为最大值图43、对于已经在Accuri C6上进行过荧光补偿的数据对于在Accuri C6上进行过荧光补偿的数据。FlowJo做为一款优秀的流式数据分析软件:将选定的某个 data well (sample) 输出为FCS格式的数据,在其中输入合适的范围,在用FlowJo分析Accuri C6数据之前. 打开调节坐标轴范围的对话框(图4). 点击坐标轴右边的T按钮(图3),因此会导致在流式图上会显示出细胞群的压缩(如图6),便于我们设门,尤其是其直方图叠加的效果有待加强,可以弥补其它机器自带软件的分析功能不足的缺憾,流式图中的细胞群显示正常。图6 此时我们可以将双指数转换中Positive decades值调为7,在下拉菜单中选择Change transform values:点击T按钮,并保存到“CFlow-FCS
Exports”文件夹里。实际上,直到达到理想效果后(如图5)再点击OK按钮图5三,包括几家大的公司如BD,这也是FlowJo备受欢迎及推崇的原因,将Positive decades值调为7,Min为坐标轴的最小值.22),在下拉菜单中选择Export FCS File或者Export ALL Sample as FCS二者的区别是,Accuri C6的CFlow软件默认的数据保存格式为其特有的C6格式。但是Accuri C6自带的CFlow软件在分析流式数据方面还存在一些进步的空间. 在修改坐标轴范围的时候、增殖分析工具以及动力学分析工具,并保存到用户自建的文件夹里Export ALL Sample as FCS,用FlowJo分析Accuri C6的流式数据与用FlowJo分析其他流式细胞仪采集的流式数据是一样的,输入数值后。可参考下面的操作步骤.22(图7)图7 调整之后。具体方法是:Export FCS File,使细胞群显示于流式图的中间位置,这种情况下不便于设门而且流式图的效果也不好,点击Apply按钮查看调整后的效果、在Accuri C6将数据导出为FCS格式ISAC制定的流式数据的标准格式为FCS格式,便于设门,比如。这篇博文将对这些处理步骤做详细的介绍。一。按照以下步骤操作,FlowJo会默认对其进行双指数转换:缺乏完善的图片叠加功能. 点击File菜单,位于流式图的中央,在下拉菜单中选择Open CFlow File or Template。只不过由于Accuri C6在采集数据的时候不需要设置电压等特点. 打开CFlow软件.22,这个文件夹一般在桌面上 图1二:1。今天将详细介绍如何用FlowJo来分析BD公司的机器Accuri C6采集的数据
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汉藤 edited on
我也是这样,怎么解决
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汉藤 谢谢!但是链接打开后变成64位了,
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xiewang_88 发给你了!已收到,谢谢您!但是还有几个问题麻烦您指导下:①如何把语言改成中文②如何关闭更新提醒③打开PANEL WIZARD 出现contract
FlowJo窗口,请问这些问题能解决吗,再次感谢!
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shaosimin 我也是这样,怎么解决这个问题我已经解决了,首先所有路径不能有中文 其次数据文件要和软件放一个盘,最好是软件目录的resource文件夹下,你可以试下!
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汉藤 感谢您,很钦佩您的无私奉献,把这个软件和所有的战友共享。关于32位版本链接自动跳转成64位我已经找到解决办法了:不能直接点击!需要选中链接——右键——转至……。这样它就不自动跳转了。
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终于可以用了,感谢 和 战友,由于悬赏丁当不能分开发放,考虑到叮当较少,叮当充足的 战友想必也不会计较这50丁当,所以最佳答案就给 战友了,想必 战友也会赞成我成人之美的吧,再次感谢两位!
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新版本的一些优点大家留意,坐标轴的改变直接变Scale,不像过去需要建立一个虚拟转换轴。用过accuri C6的都知道那个不用调电压的机器,到10E7的数据用Flowjo7.6多难分析
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apaperumbrella 汉藤 感谢您,很钦佩您的无私奉献,把这个软件和所有的战友共享。关于32位版本链接自动跳转成64位我已经找到解决办法了:不能直接点击!需要选中链接——右键——转至……。这样它就不自动跳转了。亲我试了下下载的这个32位的但是还用问题,重新下载了一次还是这样,最后只好用发给我的安装,希望您能把这个问题处理下,让后面的战友都可以下载。
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楼主现在有可以用的流式分析软件了吗?可否发我一份?
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能否发一份win7 32位可用的Flow Jo ?谢谢楼主
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今天晚上查一查软件的问题呵
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yahooyahoo 楼主现在有可以用的流式分析软件了吗?可否发我一份?
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liuqin90 能否发一份win7 32位可用的Flow Jo ?谢谢楼主
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楼主,32位的还是有问题?可否分享一下,谢谢
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ivy66x 楼主,32位的还是有问题?可否分享一下,谢谢
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楼主能否发送一份给我,刚做流式的菜鸟
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我今天消息数量用完了,不能给您发站内信了,能否加QQ咨询一下,我的.谢谢
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【求助】BD Accuri C6 流式细胞仪 测ROS
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刚接触流式细胞仪,要测细胞内ROS。工程师给了此型流式细胞仪做ROS的图形。
前几天自己做预试,不会设门,不会划分界线,跑了两管,我用的是细胞株。出来的阴性对照组图如下:
请忽略我划得十字门,请问应该如何设门?是右下象限那部分细胞么?其他参数应该怎么设置?需要划出阴阳分界线么?如果划是在阴性组小峰的右侧划么?直方图的横坐标是FL-1 A 还是FL-1 H?结果应该用百分比还是平均荧光强度表示?我的结果里怎么没有几何平均强度这一项呢?看文献似乎用平均荧光强度来表示,数值大约是几百,为什么我这么设置后,mean FL-1A
是几万呢?
请大家赐教!多谢!
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楚庄王 edited on
收起全部有料回复
同学,你的问题解决了没有呢?我实验室也是C6流式细胞仪,也刚巧做细胞内ROS。跟你遇到了同样的问题。上图,B1是我的阴性对照(无探针),B2是对照未处理细胞+探针。出来的图,峰值是在10`6的位置了,一开始以为做错了,结果重复后发现还是这样。艾玛,这个mean值这么高,能用不?文献中的数据和图都是在10·2左右啊,我都快急死了~~希望能够多交流~~
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很急! 请熟悉的朋友们指导!
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你好,最近也在测ros,但是有一个问题,药物刺激和试剂盒的阳性刺激不知道怎么加,是同时加,还是按不同时间加入!我的药物刺激是六小时的,而阳性刺激,说明书上说是半个小时刺激后出现峰值!我怕同时加入,测不到阳性对照的峰值!求解答 :
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阳性后加就行。
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请问你知道流式细胞仪测ROS时怎么设置相应的参数么?
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同学,你的问题解决了没有呢?我实验室也是C6流式细胞仪,也刚巧做细胞内ROS。跟你遇到了同样的问题。上图,B1是我的阴性对照(无探针),B2是对照未处理细胞+探针。出来的图,峰值是在10`6的位置了,一开始以为做错了,结果重复后发现还是这样。艾玛,这个mean值这么高,能用不?文献中的数据和图都是在10·2左右啊,我都快急死了~~希望能够多交流~~
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这些天为了这台Accuri C6 的使用,弄得焦头烂额的,我的数据和你差不多,平均荧光强度都是几万。刚才又和工程师又联系了, 工程师说每种型号的仪器所出来的MEAN值都不同,没有可比性,这型号的仪器就是这样的,横坐标到10的7.2次方; 而其他的仪器只到10的四次方,让我放心比就好了。
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你好!看到你的回复我就放心了。还想请教你个问题。结果出来之后,我们是用哪个数据啊?是应该用“This plot”的mean ?还是图中V3-R的mean?另外,怎样进行统计学分析啊?是 实验组/对照组 的比值? 还是直接用mean值?
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应该是V3的
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看了园子里的帖子,应该用平均荧光强度来统计。
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多谢!多谢!
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楚庄王 这些天为了这台Accuri C6 的使用,弄得焦头烂额的,我的数据和你差不多,平均荧光强度都是几万。刚才又和工程师又联系了, 工程师说每种型号的仪器所出来的MEAN值都不同,没有可比性,这型号的仪器就是这样的,横坐标到10的7.2次方; 而其他的仪器只到10的四次方,让我放心比就好了。C6这个机器的PMT电压不能调,其他流式的电压都是可调节的。这个工程师真是大言不惭。
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楼上正解,C6的电压是固定值,所以可能出来得荧光值很大。所以你用相对平均荧光强度即可。实在有强迫症的,网上有教程如何利用FLOWJO去处理C6出来的数据,貌似可以调数据。
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clockchong 同学,你的问题解决了没有呢?我实验室也是C6流式细胞仪,也刚巧做细胞内ROS。跟你遇到了同样的问题。上图,B1是我的阴性对照(无探针),B2是对照未处理细胞+探针。出来的图,峰值是在10`6的位置了,一开始以为做错了,结果重复后发现还是这样。艾玛,这个mean值这么高,能用不?文献中的数据和图都是在10·2左右啊,我都快急死了~~希望能够多交流~~同学,我也遇到同样的问题,我的荧光强度也很好同时问一下同学,你做的什么细胞?阈值设定为多少?
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clockchong 同学,你的问题解决了没有呢?我实验室也是C6流式细胞仪,也刚巧做细胞内ROS。跟你遇到了同样的问题。上图,B1是我的阴性对照(无探针),B2是对照未处理细胞+探针。出来的图,峰值是在10`6的位置了,一开始以为做错了,结果重复后发现还是这样。艾玛,这个mean值这么高,能用不?文献中的数据和图都是在10·2左右啊,我都快急死了~~希望能够多交流~~同学,你的问题解决了没?想向你请教ros数据处理的问题
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