《分子模拟——理论与实验》是2016姩10月化学工业出版社出版的图书作者是苑世领、张恒、张冬菊。
《分子模拟——理论与实验》篇主要介绍分子模拟技术基础理论内容涉及量子力学方法和分子力学方法，其中重点介绍了基于分子力学的分子动力学模拟的基本理论和实际应用第②篇为9个有代表性的实验，内容涉及无机、有机、胶化、高分子等学科可供读者亲自上机操作，重在帮助学生从分子层次上理解化学物質的结构?性能关系、动力学性质和反应特性等培养学生采用分子模拟技术解决化学问题的能力，并激发学生的科研兴趣
《分子模拟——理论与实验》可供从事计算化学的科研工作者使用，也可作为化学化工专业本科生、研究生的教材
第一篇分子模拟理论基础/1
1.2.4原子模型和粗粒模型7
1.3.5分子模拟中的系综10
1.3.7非平衡分子动力学模拟11
第2章统计力学基础17
2.1统计力学基本原理17
2.1.3其他涨落热力学性质19
2.2.1非约束粒子的运动22
2.2.2受约束粒子的运动23
3.3简单体系的分子力场32
3.4势能函数的具体形式33
3.6联合原子和约化处理49
3.7.2从全原子到粗粒模型52
3.9.2可极化水分子模型56
4.2势函数的极小值65
4.3非导数求極值法67
4.3.2按序单坐标逼近法68
4.4导数求极值法69
4.5一级导数求极值法70
4.6二级导数求极值法75
4.6.3沿对角线分块牛顿?拉森法77
4.7能量最小化方法的选择和收敛性判據77
4.8过渡态结构与反应路径78
第5章模拟中的基本原理85
5.1短程相互作用86
5.2长程相互作用94
5.3.3模拟结果和偏差分析107
第7章分子动力学模拟128
7.4分子体系中的积分方法132
7.5不同系综中的分子动力学138
8.1耗散粒子动力学模拟155
8.1.2如何选择步幅和噪声158
8.2介观动力学模拟162
8.2.4介观动力学在聚合物溶液中的应用实例166
9.1.3原子轨道线性組合近似171
9.4基函数（基组）的选择177
9.5半经验分子轨道方法181
9.5.3忽略双原子微分重叠方法（NDDO）182
第二篇分子模拟实验/183
第10章分子模型的创建与优化184
10.3复杂分孓结构的创建189
第11章分子轨道的计算和分析193
11.1分子轨道等值面图193
第12章势能面计算202
12.2分子间的弱相互作用206
12.4化学反应势能面扫描213
第13章化学反应模拟216
13.1计算化学反应的自由能216
第14章分子光谱计算226
第15章溶液行为的分子动力学模拟239
第17章表面活性剂聚集行为的介观模拟253
17.1DPD方法模拟表面活性剂在溶液中嘚聚集行为253
第18章生物膜的粗粒化模拟260
附录ⅡOrigin自定义函数拟合及构建三维势能面、能量折线图的方法284
1.自定义函数拟合284
2.绘制三维势能面285
3.绘制能量折线图287
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