医学文献助手如何使用Pubmed查文献

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2017-07-24 07:52 标签： 使用手册参考文献格式
Pubmed检索实用指南：精准搜索和全文下载
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Pubmed检索实用指南：精准搜索和全文下载
发布时间： | 来源： | 责任编辑：嗵嗵e研
PubMed是国际上公认的最具权威的生物医学文献数据库，检索文献用Pubmed，一般人都知道。不过嗵嗵还是会经常收到读者关于Pubmed和文献检索各种各样的问题，今天咱们就一次性解决问题，把Pubmed的基本、高级和精准检索功能做个梳理，大家各取所需吧。
**********基本检索功能**********
在靠近页面上部的地方，首先映入我们眼帘的，即是供我们输入所需查询内容的检索框。在检索框中输入查询词，然后单击"Search"按钮或按回车键，PubMed将会自动开始检索，并将检索到的相关条目显示在屏幕上。我们以肝癌和lncRNA为例。
呦，还不一样？对于输入Pubmed的多词词组，它会查询词组索引，如果查到相应词组会将其作为一个检索词来检索，如果没有查到相应词组，则将其拆分成单个词分别检索。所以liver cancer lncRNA就相当于Liver&AND&cancer&AND&lncRNA，我不想把词组分开咋办？可以通过以下方法：
加双引号：“liver cancer”“lncRNA”
加标段标识[tw]：liver cancer[tw] lncRNA
加短横线“-”：liver-cancer lncRNA
加截词符“*”：liver cancer* lncRNA
如果检索完毕你对这篇文章感兴趣，则直接点击进入即可：
左边是文章摘要和作者信息等，右边两个红框是全文链接：
LinkOut-more resources这里也可以链接到数据库哦：
点击任意一个进入相应的数据库，会有pdf标识的链接，然后就能下载啦!
查询的关键词类型大致可以分为：
词语（主题）检索：在检索框中直接键入英文单词或短语，大小写都可。
著者检索：在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写，注意格式为：著者姓空格+名字首字母缩写"，如施一公，shi yg.
刊名检索：在检索框中键入刊名全称或medline形式的简称、ISSN号，例如：molecularbiology of the cell, 或mol biol cell, 或，然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索，并显示检索结果。
日期检索：在检索框中键入日期或日期范围，日期的录入格式为YYYY/MM/DD；如：；只用年份或年月，如：/12。
期刊子集（辑） 检索：检索词ANDjsubseta,如：neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种：Abridged Index Medicus（有120种重要核心期刊）、Dental和Nursing。分别使用jsubseta,jsubsetd, jsubsetn进行限定。
检索带文摘的记录：检索的格式为：检索词AND has abstract,&如：liver cancer ANDhas abstract。要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE记录中没有文摘。
布尔逻辑检索：PubMed系统允许使用布尔逻辑检索，只要在检索框中键入布尔逻辑运算符（AND，OR或NOT）。具体使用时要注意的问题，详见上第2点所述。
**********高级检索功能**********
如果你要是有所针对，特异性的搜索具体作者、杂志或者其他信息等，还可以进行更加高级的检索， 高级检索技巧有两个入口：一个入口是通过搜索前的advanced进入，就在pubmed首页搜索框的下面。
这里有三个高级搜索选型：
1.是左侧的and or not选项，很好理解。
2.是搜索框选型，fieids，选择你需要选择的搜索范围。
3.是index索引，以cancer为例，点击list，出现下图内容，可以很方便的选择子方向，这个选项可以大大的提高我们的检索效率，缩小工作范围。
第二个功能入口：是我们搜索之后的界面，在左侧的选项。
还是以cancer为例，左侧出现了additional filter，这里我们可以把我们需要的内容进行筛选，比如我需要找到临床试验类型的文章，就在article types 中点击clinical trial，需要查看最近5年的文章，就选择publication data 5 years，等等。这个功能能够帮助我们快速的筛选出我们需要的文章类型，很好用。
想要查看pubmed的检索的详细内容，可以点击右下侧的search details，点击see more，你将会看到pubmed的全部搜索信息，同时提供修改。
**********精准检索功能**********
PubMed上找论文时，如果关键词好几个，由于单词间的空格键存在AND命令，导致明明要搜的是词组，搜索不是被放大就是缩小，很难检索到合适且关联度高的文。例如，你想找和肠炎与肿瘤坏死因子相关论文，搜索关键词：Inflammatory&bowel&disease&TNF。结果如下：
试试搜索关键词：IBD&TNF
如果还想要基因检测方向的呢？搜关键词：genetic&test&IBD&TNF
用简称缩写确实一下子就将目标范围缩小了好几倍，然而很多词汇并没有简称，而且由于单词间的空格存在AND命令，将多个关键词一起输入时很容易导致找不到，需要交集计算的太多啦！找个文献难不成还要先熟练一下搜索命令又是引号又是括号吗？当然不用啦，又不是程序员！
怎么才能快速搜到我想要的论文呢？别急，看看下面在基因检测方向怎样快速靶向定位的例子，你就一切都了然了。
1、首先选择PudMed的使用工具下的临床资料（Clinical Queries）
2、输入一级关键词”IBD”
3、在左右两边的临床研究目录以及临床遗传学下选择范围，如病因、诊断、治疗、预后和临床预测指南等。
选择右下的see&all，回到PubMed主页。
4、输入你的二级关键词：TNF，根据你的需要选择排序方式。例如，出版时间、关联度、杂志等。选择很多年前的文章作为参考文献，数量就不能多！如果五年十年前的参考文献超过70%，这是打算写给谁看呢？
OK啦，你的目的达到了。
除此之外，你也可以通过布尔（BOOLEAN）运算来提高你的效率，最常用的三种布尔运算即是AND,OR和NOT。
AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语并列列出，OR则是将出现至少一个关键词的文章列出，这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时，十分有效。NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。
但是在使用的时候要特别注意，会有可能将一些你所需要的文章漏掉。比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时，除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章，同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章。
**********收尾：批量保存和打印文献**********
Pubmed建立的生物医学文献检索系统，免费文献比例有限，不过一般高校都会买数据库权限，大家在校园局域网内可以任性下载文献、了解领域内科研前沿。&检索好自己想要的文献，免不了要收藏保存。打开Summary下拉菜单选择其中一种格式，然后点击Save键；要保存特定记录时，点击记录左边的选择框予以标记后，再点击Save键。&
使用浏览器的打印功能，即可把感兴趣的内容打印出来。系统允许每页最多显示500条记录。如果想打印成文本格式，请先点击Text键，然后再打印。到这 pubmed检索的一些基本功能，了解更深入的功能请继续关注嗵嗵e研。
如何确定Δ的大小
横竖大不同——文章表格中应该提供“率”还是“构成比”
配对t检验，你用对了吗？
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