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【求助】现有人GAPDH引物能用于大鼠吗?
现有人GAPDH引物一对：5‘－AGAAGGCTGGGGCTCATTTG－3’5‘－AGGGGCCATCCACAGTCTTC－3’（238bps）在pubmed上BLAST见：PREDICTED: Rattus norvegicus similar
to Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) (LOC307263), mRNA 40.1 40.1 100% 0.034 100% 不知道这种similar的能否拿来用？帮你看了一下，能通大鼠XR_GAPDH基因很好匹配，因为gapdh保守性很好，应该能扩出来。扩增长度在大鼠应该为258bp。我用大鼠扩过人的，其中还有两个错配，也出来了。你这个我认为应该有80％的把握弄出来。人的GAPDH的CDS序列
ccatggggaa
ggtgaaggtc ggagtcaacg gatttggtcg tattgggcgc ctggtcacca gggctgcttt taactctggt aaagtggata ttgttgccat caatgacccc ttcattgacc tcaactacat ggtttacatg ttccaatatg attccaccca tggcaaattc catggcaccg tcaaggctga gaacgggaag cttgtcatca atggaaatcc catcaccatc ttccaggagc gagatccctc caaaatcaag tggggcgatg ctggcgctga gtacgtcgtg gagtccactg gcgtcttcac caccatggag aaggctgggg ctcatttgca ggggggagcc aaaagggtca tcatctctgc cccctctgct gatgccccca tgttcgtcat gggtgtgaac catgagaagt atgacaacag cctcaagatc atcagcaatg cctcctgcac caccaactgc ttagcacccc tggccaaggt catccatgac aactttggta tcgtggaagg actcatgacc acagtccatg ccatcactgc cacccagaag actgtggatg gcccctccgg gaaactgtgg cgtgatggcc gcggggctct ccagaacatc atccctgcct ctactggcgc tgccaaggct gtgggcaagg tcatccctga gctgaacggg aagctcactg gcatggcctt ccgtgtcccc actgccaacg tgtcagtggt ggacctgacc tgccgtctag aaaaacctgc caaatatgat gacatcaaga aggtggtgaa gcaggcgtcg gagggccccc tcaagggcat cctgggctac actgagcacc aggtggtctc ctctgacttc aacagcgaca cccactcctc cacctttgac gctggggctg gcattgccct caacgaccac tttgtcaagc tcatttcctg gtatgacaac gaatttggct acagcaacag ggtggtggac ctcatggccc acatggcctc caaggagtaa 大鼠的CDS序列1 ccactaaagg gcatcctggg ctacactgag gaccaggttg tctcctgtga cttcaacagc61 aactcccatt cttccacctt tgatgctggg gctggcattg ctctcaatga caactttgtg121 aagctcattt cctggtatga caatgaatat ggctacagca acagggtggt ggacctcatg181 gcctacatgg cctccaagga gtaa所以你的人GAPDH引物不能用于大鼠大鼠的：NM_023964 （编码区4－1032bp）人 ：NM_002046.（编码区103－1110bp）二者编码区比对结果：DNAMAN14NAMAN14 identity= 68%110
AGGTGAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGGTCGTATTGGGCGCCTGGTCACCAGGGCTGCTT
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AGCTAACAGTGGGCATCAATGGATTTGGACGCATTGGTCGTCTGGTGCTACGAGTCTGCA170
TTAACTCTGGTAAAGTGGATATTGTTGCCATCAATGACCCCTTCATTGACCTCAACTACA
| |||||||| |||||||| |
TGGAGAAGGGC...GTTCGGGTAGTAGCAGTGAATGACCCATTCATTGATCCAGAATACA230
TGGTTTACATGTTCCAATATGATTCCACCCATGGCAAATTCCATGGCACCGTCAAGGCTG
|||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| | || | | || || ||
TGGTGTACATGTTCAAATATGACTCCACACATGGTAGATACAAAGGAACGGTGGAACATA290
AGAACGGGAAGCTTGTCATCAATGGAAATCCCATCACCATCTTCCAGGAGCGAGATCCCT
|||| | | ||||||
AGAATGGACGACTAGTTGTGGACAACCTTGAGATCAACGTGTTCCAGTGCAAAGAACCTA350
CCAAAATCAAGTGGGGCGATGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTCA
||||| |||||
|||| || || | | 536
AGGAAATCCCCTGGAGCTCTGTAGGGAATCCCTACGTGGTGGAAGCCACAGGTGTATACC410
CCACCATGGAGAAGGCTGGGGCTCATTTGCAGGGGGGAGCCAAAAGGGTCATCATCTCTG
| |||||| || |||596
TGTCCATAGAGGCGGCTTCGGGGCACATTTCATCTGGTGCCAGGCGTGTCATCGTCACTG470
CCCCCTCTGCTGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTGAACCATGAGAAGTATGACAACA
| ||||| |||||||| ||||||||||||||
|| | ||| ||
CACCTTCCCCCGATGCACCCATGTTGGTCATGGGTGTGAATGAGAAGGACTATAACCCTG530
GCCTCAAGATCA...TCAGCAATGCCTCCTGCACCACCAACTGCTTAGCACCCCTGGCCA
|||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| || |716
GCTCCATGACCGTTGTCAGCAATGCATCCTGTACCACCAACTGCCTGGCCCCCCTCGCTA587
AGGTCATCCATGACAACTTTGGTATCGTGGAAGGACTCATGACCACAGTCCATGCCATCA
|||| || || ||
||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||
AGGTTATTCACGAACGCTTCGGGATCGTGGAAGGGCTAATGACCACCGTCCATGCCTACA647
CTGCCACCCAGAAGACTGTGGATGGCCCCTCCGGGAAACTGTGGCGTGATGGCCGCGGGG
| ||||| |||||||| ||||| || || ||
||||| | |||||| || |836
CGGCCACTCAGAAGACAGTGGACGGGCCATCAAAGAAGGACTGGCGAGGTGGCCGAGGTG707
CTCTCCAGAACATCATCCCTGCCTCTACTGGCGCTGCCAAGGCTGTGGGCAAGGTCATCC
| | |||||||||||||||
| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||896
CCCACCAGAACATCATCCCATCTTCCACTGGGGCTGCCAAGGCTGTAGGCAAAGTCATCC767
CTGAGCTGAACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTCCCCACTGCCAACGTGTCAG
| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || || ||
| ||||| ||||956
CAGAGCTCAATGGGAAGTTAACAGGAATGGCATTCCGGGTGCCAACCCCAAACGTATCAG827
TGGTGGACCTGACCTGCCGTCTAGAAAAACCTGCCAAATATGATGACATCAAGAAGGTGG
| ||||||||||||||||| || |
|||||| |||
TTGTGGACCTGACCTGCCGCCTGGCTCAGCCTGCTTCCTACACTGCTATCAAGGAGGCTG887
TGAAGCAGGCGTCGGAGGGCCCCCTCAAGGGCATCCTGGGCTACACTGAGCACCAGGTGG
|||||||| |
|| || ||| |||||||||1076
TGAAAGCAGCAGCCAAGGGACCTATGGCTGGCATCCTTGCTTATACAGAGGACCAGGTGG947
TCTCCTCTGACTTCAACAGCGACACCCACTCCTCCACCTTTGACGCTGGGGCTGGCATTG
||||| | ||||| ||
|||| || |||| |||||| |||
|||||| ||||1136
TCTCCACGGACTTTAATGGCGATTCCCATTCTTCCATCTTTGATGCTAAGGCTGGAATTG二者蛋白同源性比对：
VKVGVNGFGRIGRLVTRAAFSCDKVDIVAINDPFIDLNYMVYMFQYDSTHGKFNGTVKAE
||||||||||||||||||||
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||4
VKVGVNGFGRIGRLVTRAAFNSGKVDIVAINDPFIDLNYMVYMFQYDSTHGKFHGTVKAE62
NGKLVINGKPITIFQERDPANIKWGDAGAEYVVESTGVFTTMEKAGAHLKGGAKRVIISA
|||||||| ||||||||||
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||64
NGKLVINGNPITIFQERDPSKIKWGDAGAEYVVESTGVFTTMEKAGAHLQGGAKRVIISA122
PSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITA
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||124
PSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIISNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITA182
TQKTVDGPSGKLWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTPNVSVV
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||184
TQKTVDGPSGKLWRDGRGALQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTANVSVV242
DLTCRLEKPAKYDDIKKVVKQAAEGPLKGILGYTEDQVVSCDFNSNSHSSTFDAGAGIAL
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||
|||||||||||||244
DLTCRLEKPAKYDDIKKVVKQASEGPLKGILGYTEHQVVSSDFNSDTHSSTFDAGAGIAL302
NDNFVKLISWYDNEYGYSNRVVDLMAYMASKE
|| ||||||||||| ||||||||||| |||||304
NDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMAHMASKE中午有些匆促，差点误了楼上战友的事，抱歉！！！从比对结果可见，编码区核酸差别较大，但蛋白较小，可能密码子选择有偏向！你的引物不在同源性较大的位点，所以扩不出来大鼠的gapdh，至于XR_只是一个预测的核算，不是公认的gapdhmrna序列。我的恰巧在二者同源性较高的地方，所以成功了，万幸。感谢残月1980的细心！！！新订了大鼠gapdh还是查不出来，可能我查的方法不对？F1029&&5'&&ACAGCAACAGGGTGGTGGAC&&&&R1280&&5'&&TTTGAGGGTACAGCGAACTT
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中学教育“生生不息”第九期(上).doc 10页
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主编：刘恩山朱正威责编：张怡吴成军编委：刘恩山朱正威张怡吴成军王　健霍静张颖之李辛陶张春雷李明玉刘　晟乔萌萌开篇寄语专题简介热点聚焦老师们好！网络研修已经进行到了第九天，你们一定非常辛苦。老师们积极参与网络研修交流的热情，让我们对今天的研修有了更多的期待！今天，我们的研修内容是选修一《生物技术实践》，大家已经通过研读课程标准，了解到本模块的内容包括：微生物的利用、酶的应用、生物技术在食品加工中的应用和生物技术在其他方面的应用。可以看出这是一个以学生实践操作为主的课程。在高中生物学课程设置中,《生物技术实践》是一个全新的模块，具有独特的教育价值：一是可以培养学生的探究能力；二是提升学生的实验操作技能；三是对生物技术在生活和生产实践等方面有更深入的理解，为将来选择理工类方向的学生打好学习基础。这个模块对于教师的专业化发展也有很大的促进作用，例如，对教师的实验操作技能、教学组织和管理能力、学业评价的理念和方法都有更高的要求。有的老师可能说，我们没有实验条件，是无法完成这么多的实验的。其实，按照课程标准的要求，我们只需要选择其中的5-7个实验进行教学，就可以达到课程标准的要求。当然，就我们现在的生物实验教学条件看，确实需要老师们开创性地去实践这个模块。今天，我们就本模块教学内容的选择、教学策略的确定以及评价方案的设计等方面进行研讨。希望老师们一如既往地参与网上研讨，让大家共享你对本模块教学的设想。谢谢！专题九《生物技术实践》模块（简介）专题负责人张怡 北京市西城区教育研修学院 北京市西城区生物教研员
高级教师吴成军人民教育出版社生物室
副编审问题的提出及在教学实践中的价值：高中生物课程中最具有挑战性的教学内容就是选修模块一“生物技术实践”。这不仅是因为该教学内容的授课需要实验室和其他的设备、条件，也是因为生物技术第一次大量进入生物学课程时我们的师范教育尚未有相应的准备。多数教师在准备该选修模块时会感到不熟悉、不适应。这个模块教学中的具体问题，如知识、技能、设备、材料和实验方法等是教师们期待解决和研讨的内容。这也是选修课程中唯一一个以实践为主做科学的模块。需要解决的问题：如何根据本校的实际情况进行实验设备的补充和更新？怎样选择适合本校条件的生物技术实践活动？如何提高几个有代表性生物技术实践活动的成功率？一．选修模块的设计思路1.作者：石霄凌(高中生物?河北邢台生物一班)学习“生物技术实践”模块的目的是什么？张怡：“生物技术实践”模块的设置在我国生物课程史上是开创性的，把以学生动手实践为主的内容作为课程这是第一次。因此说“生物技术实践”模块的教育价值是其他模块无法替代的。通过本模块的教学应该达到的教育目的是提高学生的生物科学素养，尤其是科学探究能力；同时为选择理工类研究方向的学生奠定知识、操作技能的基础，促进学生情感、科学态度与精神等方面的发展。由于学校实验条件的限制，开展“生物技术实践”模块的教学需要教师和学生因陋就简创造条件来完成，可以说本模块的目的还应该有“创新实践能力”的培养。作者：王曦(高中生物?湖北随州生物一班)选修的内容在课时安排和重点上应该怎么把握？恩山：11个生物技术实验供教师在本校开设该课程时选择。教师根据本校实验室、实验器材、实验耗材及本人专业背景等因素，选择5～7个实验作为这一课程的学习内容。该模块的总课时是36学时，每个实验活动平均为6个学时左右。该模块的重点是让学生在动手实践中深入理解和应用必修模块中已经学习到的生物学概念和原理，领悟生物技术及其工作的特点，学习科学和技术工作的方法。在教学方法上，课程标准要求这一模块要将绝大多数的课时用于学生的动手活动，而不是教师讲解。课程中具体开设哪些实验活动并不是最重要的，关键是要将实验开出、开足（足够的数量）。二．选修模块一的教学3.作者：张敏(高中生物?云南昭通生物一班)选修中的实验设计的非常好，紧密联系实际而且也不算难做，可是很多实验都要持续数周甚至是数月时间，我们有那么充分的时间做实验吗？吴成军：张老师的问题很好，这也是我们在制定教学计划时需要考虑的问题。一是我们只需选择其中的5-7个实验进行教学就可以完成课程目标为此，我们应该尽量选择不同的专题，让学生对生物技术的不同应用有所了解，因此，持续时间长的实验不一定都会选入我们所做的范围；其次，有的实验尽管持续时间较长，但并不要求每个学生每天或每节课都进行观察和管理，例如，酒和果醋的制作等制作课题，组培等课题，要求学生课余进行观察就行，或指定小组组长、课代表进行观察、管理就行；第三，有的实验尽管时间持续较长，但不是要求学生将该实验的所有环节都体验或操作一遍，例如，植物的组织培养，我们可根据学生的实际情况选择性地让学生进行操作，以体验组培的基本过程；第四，教师也应该转变观念，合理安排实验顺序，例如，制作果酒和果醋课题
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