vasp结构弛豫豫过程引起结构的变形是什么原因

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zrcunial非晶合金的原子尺度结构演变和变形行为研究
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正文/结构弛豫
  玻璃态结构在适当温度下的渐变过程。在高于软化温度(Tg)时,结构的变化几乎是瞬时的,以致玻璃总是保持着平衡状态。在低于转化温度(Tg)时,结构变化又非常缓慢,以致玻璃总是处于。只是在Tg和Ts这段范围内,随着时间的增加非平衡状态逐步趋向于平衡态。这种结构状态变化与时间的关系是玻璃内部某些原子或分子局部重排的结果,称为结构弛豫。它是存在于(包括有机、无机氧化物和非氧化物、金属玻璃)中的一个普遍现象,发生在玻璃的形成过程、热处理过程以及使用和保存过程之中。   由于结构弛豫,玻璃的物理化学性质在很大程度上依赖于其热历史。在玻璃快速冷到室温后,它经常保持着玻璃在 Tg~Ts这段转变温度范围内某一温度的性质。A.Q.图尔在20世纪40年代,首先把这一温度称做假想温度Tf。并由假想温度引入与它相对应的物理-化学态来描述玻璃的结构。   图尔认为玻璃假想温度的变化速率正比于它对实际温度的偏离,反比于玻璃的粘度,而玻璃的粘度是实际温度和假想温度的函数,并提出一个与结构弛豫有关的方程: 式中t为时间,T为实际温度,k、g、h均匀常数。这就是图尔模型。它可以定性地解释热历史对许多玻璃性质的影响。   实际玻璃结构的是比较复杂的。应用一个单一的参量(假想温度Tf)还不能完全确定非平衡态玻璃的结构。实际玻璃的结构弛豫过程常呈现出较复杂的非指数式弛豫行为。70年代初,有人应用应力弛豫的数学处理来分析结构弛豫,提出了“多参量结构模型”。这个模型可以定量地描述不同历史玻璃性质的时间依从性。   参考书目  A.Q.Tool,Jour.Am.CeRam.Soc.,Vol.29,No.9,p.240,1946.&
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贡献光荣榜(1)收敛判据的选择;结构弛豫的判据一般有两种选择:能量和力;到底是以能量为收敛判据,还是以力为收敛判据呢?关;在我看来,这取决于所研究的问题的复杂程度;原子本身及其化学环境有关,还会与几何构型有关;对于涉及构型敏感性的结构优化过程,我觉得,以力作;(2)结构优化参数设置;结构优化,或者叫弛豫,是后续计算的基础;初始结构;初始结构包括原子堆积方式,和自旋、磁
(1)收敛判据的选择
结构弛豫的判据一般有两种选择:能量和力。这两者是相关的,理想情况下,能量收敛到基态,力也应该是收敛到平衡态的。但是数值计算过程上的差异导致以二者为判据的收敛速度差异很大,力收敛速度绝大部分情况下都慢于能量收敛速度。这是因为力的计算是在能量的基础上进行的,能量对坐标的一阶导数得到力。计算量的增大和误差的传递导致力收敛慢。
到底是以能量为收敛判据,还是以力为收敛判据呢?关心能量的人,觉得以能量为判据就够了;关心力相关量的人,没有选择,只能用力作为收敛标准。对于超胞体系的结构优化,文献大部分采用Gamma点做单点优化。这个时候即使采用力为判据(EDIFFG=-0.02),在做静态自洽计算能量的时候,会发现,原本已经收敛得好好的力在不少敏感位置还是超过了结构优化时设置的标准。这个时候,是不是该怀疑对超胞仅做Gamma点结构优化的合理性呢?是不是要提高K点密度再做结构优化呢?
在我看来,这取决于所研究的问题的复杂程度。我们的计算从原胞开始,到超胞,到掺杂结构,到吸附结构,到反应和解离。每一步都在增加复杂程度。结构优化终点与初始结构是有关的,如果遇到对初始结构敏感的优化,那就头疼了。而且,还要注意到,催化反应不仅与
原子本身及其化学环境有关,还会与几何构型有关。气固催化反应过程是电子的传递过程,也是分子拆分与重新组合的过程。如果优化终点的构型不同,可能会导致化学反应的途径上的差异。仅从这一点来看,第一性原理计算的复杂性,结果上的合理性判断都不是手册上写的那么简单。
对于涉及构型敏感性的结构优化过程,我觉得,以力作为收敛判据更合适。而且需要在Gamma点优化的基础上再提高K点密度继续优化,直到静态自洽计算时力也是达到收敛标准的。
(2)结构优化参数设置
结构优化,或者叫弛豫,是后续计算的基础。其收敛性受两个主要因素影响:初始结构的合理性和弛豫参数的设置。
初始结构包括原子堆积方式,和自旋、磁性、电荷、偶极等具有明确物理意义的模型相关参数。比如掺杂,表面吸附,空位等结构,初始原子的距离,角度等的设置需要有一定的经验积累。DFT计算短程强相互作用(相对于范德华力),如果初始距离设置过远(如超过4埃),则明显导致收敛很慢甚至得到不合理的结果。
比较好的设置方法可以参照键长。比如CO在O顶位的吸附,可以参照CO2中C-O键长来设置(如增长20%)。也可以参照文献。记住一些常见键长,典型晶体中原子间距离等参数,有助于提高初始结构设置的合理性。实在不行,可以先在小体系上测试,然后再放到大体系中算。
弛豫参数对收敛速度影响很大,这一点在计算工作没有全部铺开时可能不会觉察到有什么不妥,反正就给NSW设置个“无穷大”的数,最后总会有结果的。但是,时间是宝贵的,恰当的设置3小时就收敛的结果,不恰当的设置可能要一个白天加一个黑夜。如果你赶文章或者赶着毕业,你就知道这意味这什么。
结构优化分电子迭代和离子弛豫两个嵌套的过程。电子迭代自洽的速度,有四个响很大的因素:初始结构的合理性,k点密度,是否考虑自旋和高斯展宽(SIGMA);离子弛豫的收敛速度,有三个很大的影响因素:弛豫方法(IBRION),步长(POTIM)和收敛判据(EDIFFG).
一般来说,针对理论催化的计算,初始结构都是不太合理的。因此一开始采用很粗糙的优化(EDIFF=0.001,EDIFFG=-0.2),很低的K
点密度(Gamma),不考虑自旋就可以了,这样NSW&60的设置就比较好。其它参数可以默认。
经过第一轮优化,就可以进入下一步细致的优化了。就我的经验,EDIFF=1E-4,EDIFFG=-0.05,不考虑自旋,IBRION=2,其它默认,NSW=100;跑完后可以设置IBRION = 1,减小OPTIM(默认为0.5,可以设置0.2)继续优化。
优化的时候让它自己闷头跑是不对的,经常看看中间过程,根据情况调节优化参数是可以很好的提高优化速度。这个时候,提交两个以上的任务排队是好的方式,一个在调整的时候,下一个可以接着运行,不会因为停下当前任务导致机器空闲。
无论结构优化还是静态自洽,电子步的收敛也常常让新手头痛。如果电子步不能在40步内收敛,要么是参数设置的问题,要么是初始模型太糟糕(糟糕的不是一点点)。
静态自洽过程电子步不收敛一般是参数设置有问题。这个时候,改变迭代算法(ALGO),提高高斯展宽(SIGMA增加),设置自洽延迟(NELMDL)都是不错的方法。对于大体系比较难收敛的话,可以先调节AMIN,BMIX跑十多步,得到电荷密度和波函数,再重新计算。实在没办法了,可以先放任它跑40步,没有收敛的迹象的话,停下
来,得到电荷密度和波函数后重新计算。一般都能在40步内收敛。
对于离子弛豫过程,不调节关系也不大。开始两个离子步可能要跑满60步(默认的),后面就会越来越快了。
总的说来,一般入门者,多看手册,多想多理解,多上机实践总结,比较容易提高到一个熟练操作工的水平。
如果要想做到“精确打击”,做到能在问题始发的时候就立刻采取有效措施来解决,就需要回归基础理论和计算方法上来了。
高手啊高手,到底是什么样的境界?
(3)优化结果对初始结构和“优化路径”的依赖
原子吸附问题不大,但是小分子吸附,存在初始构型上的差异。slab上水平放置,还是垂直放置,可能导致收敛结果上的差异。根据H-K理论,理想情况下,优化得到的应该是全局最小,但在数值计算的时候可能经常碰到不是全局最小的情况。实际操作中发现,多个不同初始结构优化收敛后在能量和结构上存在一定差异。
为了加快收敛速度,特别是对于表面-分子吸附结构,初始放松约束,
三亿文库包含各类专业文献、文学作品欣赏、生活休闲娱乐、应用写作文书、高等教育、行业资料、外语学习资料、各类资格考试、专业论文、关于结构弛豫设置及收敛判据选择的一点体会45等内容。 
 尽管如此,对于大多数有关分子动力学的任务还是可以...收敛判据的选择 结构弛豫的判据一般有两种选择:能量...小时就收敛的结果, 不恰当的设置可能要一个白天加一...  对于长时间的分子动力学的模拟,精度小一点也无所谓...不设的话,等于 TEBEG. SMASS -3 NVE-...收敛判据的选择 结构弛豫的判据一般有两种选择:能量...  还有一个参数就是电 子步的收敛标准的设置 EDIFF,...结构弛豫结构弛豫的判据一般有两种选择: 能量和力。...回车 top 就可以了 心得体会: 在对材料进行其他...君,已阅读到文档的结尾了呢~~
大块金属玻璃Pd40Ni10Cu30P20结构弛豫的研究
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