vmd如何制作动图利用VMD选择氧原子

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VMD视觉营销
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&&视​觉​营​销​在​现​代​化​零​售​业​中​起​的​作​用​越​来​越​大
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如何利用VMD实现DNA片段的着色?
刚接触VMD没多久,对其中的一些功能不熟悉,现在遇到了一些问题,还请大家指点一二,谢谢!
& & 下图是我看有关文献,给出的图片,看起来很漂亮。
& &&&而我做出的图片极丑,如下图:
& &&&调试了好久,还是不理想,麻烦大家指教一下!
& && &谢谢!
vmd可以实现任何你想要的着色方案,甚至每个原子你都可以给他自己规定的颜色
Graphics/Representations/Coloring Method/ColorID
现在还是在摸索中,调试了一段时间了,还是没有出现自己想要的的结果,不过感谢你的回复!
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求助VMD里面水的表示。。或者存储rst7的格式。。。
想要取出来某原子半径15A内的所有水分子和蛋白,然后存储成标准格式的rst7,也就是6F12.7,一行六个坐标两个原子的那个,但是直接存储出来是一行十个坐标,后续处理不方便啊。。。这个有啥办法可以存储成6F12.7的么?
然后想着,如果不行从头开始,于是想要用VMD的save coordinates来存pdb然后leap再处理,
但是water and within 15.0 of name C, 但是在边缘区域的水分子不完整,只有个H或者只有个O,用leap试图添加缺少的原子但是好像leap或者是咱。。还是不够智能总是失败。。。
编程实在乏力:cry::cry::cry::cry:求助
感谢回复,我之前没用过VMD的命令行方式,不知道为什么最后存出来的pdb是空文件?我输入文件里面水里面的氧,名字是O,于是我把第一条命令中的OW换成O,其他的没有变化,然后执行完了第二条命令之后,终端里面显示了出来了WAT WAT WAT WAT。。。。感觉应该是成功选中了,但是最后出来是空文件,不知怎解?
顺便想问一下。。。您对VMD源码熟悉么?我想直接去改http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/doxygen/crdplugin_8c-source.html 这里面的8.3部分改成需要的12.7,但是以前没改过vmd,找了半天也不知道在哪里改。。。
你能把你的 初始文件附上来吗? 我试试。
我没有研究过VMD 的源代码,VMD 的TCL语言命令,足够我使用的了。
谢谢!请看下站内消息,直接把文件发到这里有点那个。。。
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随时随地聊科研什么是VMD?
念念丶5218
关于VMD的定义,很多人都会说是英文Visual Merchandising的缩写,中文意思就是“视觉营销”或者“商品计划视觉化”,然后就忙着在操作层面上解释了.比如如何进行商品计划、决定商品构成、如何对色彩、尺码、形状进行有序陈列、道具、家具的摆放、卖场环境整顿、POP、照明……把一些列工作的具体操作方法整理分类加以宣传?其实,VMD不仅仅是一种方法,其实还是一种理念,就像会计除了是一种工具以外,更是反映并指导企业战略的一面镜子.(图片与文章无关) 中国的VMD论主要源自日本,而日本是从美国学到后改为自己使用的专有词汇.在美国使用视觉化商品营销,简称VM.接下来就让我们来看看几本日本教科书里是如何定义VMD的吧.1.《VMD用语词典/CHANELLER》 1988年日本Visual Merchanding协会定义.“VMD,顾名思义,商品计划视觉化,即在流通领域里表现并管理以商品为主的所有视觉要素的活动,从而达到表现企业独特性以及与其他企业差别化的目的.这项活动的基础是商品计划,必须要依据企业理念来决定.” 欧美把这个词缩写成VM,在日本VMD较为常用.概括一下,就是只要让商品看起来很好很有魅力就OK的活动,而且是在企业理念指导下进行的.(图片与文章无关) 2.《Visual Merchandiser》/早乙女喜荣子著/织研新闻社 VMD指的是表现视觉表现第一位的MD(Merchandising)的技术.从商品计划到进货、陈列、表现、内部装修、道具设计等的店铺环境表现,直至卖场的POP、标识、告示板等图形表现,把店铺想要向顾客传达的信息用可见的形式表现出来的技术.也可以说是把SI(Store Identity)、CI(Corporate Identity)具体表现出来,这便是“视觉的商品化计划”.事先对SI(店铺主意·主张)、店铺环境特征、周围场地条件、商圈、顾客等掌握分析,有计划地纳入商品,再把这些商品分为几个类别,有效配置在卖场内,通过各种各样的表现和陈列方法,利用最佳的道具构成.同时,MD是不断流动变化的,因此VMD的表现方法和实施方法也必须要灵活多变.在美国,VMD被简称为VM,或者称为VMD&SD(Visual Merchandising and Store Design),或者用VMD&Display(Visual Merchandising and Display)来表示.换言之,VMD需要制造用于零售的“躯干”(如店铺环境和卖场),同时还需要商品构成的“灵魂”,二者缺一不可.一说到让商品有魅力,大家总是不自觉地在商品本上上下功夫,环视卖场,如果没有整个周围环境的出色表现,就会让人觉得商品非常地突兀,鹤立鸡群.(图片与文章无关) 3.《时装销售员的常识和必须用语400/商业界》 视觉表现第一位的整个MD(Merchandising)活动.以视觉的诉求为中心介绍说明店铺的商品构成和商品价值.也就是说,对于根据符合店铺概念的方针精选出来的商品,以视觉诉求为中心,综合表现商品的陈列方法和商品信息的发出方法,简称VMD.看来让商品变得更有魅力不仅仅是表现出来就够了.通过综合店铺的概念,商品的概念所有这些之后,如何发出商品信息才是关键.(图片与文章无关) 4.《商业用语词典/商业界》 计算视觉效果的商品计划,通常简称VMD,它不仅仅停留在商品陈列,而且与装饰品、店铺设计、印象都有着很大的关系.即,根据企业战略整顿店铺环境本身会给顾客留下深刻印象,促使顾客购买商品.从这一点来看,说VMD是零售经营综合战略的一部分领域也不为过.根据企业战略整顿店铺环境,给顾客留下深刻印象,从而使顾客购买商品.VMD在美国的卖场计划和活动策划中起到重要角色,而在日本,VMD的总负责人却仍然不在多数.可以说这是一个将来必须要大力发展的领域.(图片与文章无关) VMD在日本都属于亟待认知和发展的领域,更不消说中国了.所以重视VMD是零售业发展的必然趋势,在我们认为已经很不错的商品计划、商品陈列、店铺设计上仍然大有文章可做.就从上面四个概念,我们也不难从超出技巧和操作的层面看到什么是VMD了.VMD是根据企业理念决定的.VMD把店铺想要传达给顾客的信息以所见即所得的形式表现出来.VMD要考虑如何发出商品信息.VMD将成为今后大力发展的一个领域.
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