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Arlequin操作说明
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Arlequin操作说明
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这个帖子发布于9年零16天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
请问如何利用Arlequin计算Y-STR的单体型多样性（haplotype diversity）以及基因频率多样性（gene diversity）？谢谢
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柚子 请问如何利用Arlequin计算Y-STR的单体型多样性（haplotype diversity）以及基因频率多样性（gene diversity）？谢谢请问您的问题解决了吗？我有同样的困扰
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当时肯定是解决了，现在这么久了已经忘记了
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柚子 当时肯定是解决了，现在这么久了已经忘记了Arlequin 软件中AMOVA分析，选择地方是灰色的，选不上，怎么办？谢谢我获得的是单倍型数据，怎样输入，我按照他给的例子为什么总是不对？
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柚子 当时肯定是解决了，现在这么久了已经忘记了Arlequin软件给的例子如下：请问一下SampleData中000,001，002,003,004代表什么？[Profile]Title=&Frequency data&NbSamples=2GenotypicData=0DataType=FREQUENCY[Data][[Samples]]SampleName=&Population taiwan&SampleSize=16SampleData= {000 1001 3002 1003 7004 4}SampleName=&Population 2&SampleSize=23SampleData= {000 3001 6002 2003 8004 4}
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前面是样品编号，后面表示位点的重复次数。下面是我当时的部分数据，希望对你能有帮助。#There are 5 loci
BT1, BT6, BT12 and BT13 #The microsatellite alleles are expressed as the PCR fragment size
SampleName=&DW&
SampleSize=38
SampleData={DW01 1 23 15 12 18 14DW02 1 23 15 12 20 15DW03 1 25 15 12 21 14DW04 1 24 15 12 19 15DW05 1 24 15 12 18 14DW06 1 27 15 11 18 12DW07 1 23 15 12 20 15DW08 1 22 16 12 20 14DW09 1 25 15 12 19 15DW10 1 25 15 12 19 14
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柚子 前面是样品编号，后面表示位点的重复次数。下面是我当时的部分数据，希望对你能有帮助。#There are 5 loci
BT1, BT6, BT12 and BT13 #The microsatellite alleles are expressed as the PCR fragment size
SampleName=&DW&
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SampleData={DW01 1 23 15 12 18 14DW02 1 23 15 12 20 15DW03 1 25 15 12 21 14DW04 1 24 15 12 19 15DW05 1 24 15 12 18 14DW06 1 27 15 11 18 12DW07 1 23 15 12 20 15DW08 1 22 16 12 20 14DW09 1 25 15 12 19 15DW10 1 25 15 12 19 14前面是样品编号，我是想跟其他人群对比，第一个sample和第二个sample中都有001，,002，他们代表的是相同的意思还是各自不同？还有为什么我的Arlequin 软件中AMOVA分析时，选择地方是灰色的，选不上谢谢
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每一个sample实际上是代表一个人群。每一行代表一条染色体，第一个1代表这种单体型的数目，后面的各个数字代表每个STR位点的重复次数。这里面的数据实际上不涉及到个体的样品编号。至于AMOVA的问题，我就不清楚了。
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如果AMOVA是灰色的选不上 很有可能是你的群体分层不对，我也出现这样的问题了，还是没解决....
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小女子正准备做AMOVA分析，一头雾水，请求大家的知道，谢谢了。
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请问您的问题现在都解决了么？会了请教下我啊～～我下载的版本没有EXAMPLE文件～～急需您的帮忙～我做DNA～如果有版本参照，感激涕零～～请发我邮箱。谢谢！
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帮助很大！！谢谢！
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关于丁香园自然选择怎样影响种群的基因频率_百度知道关注今日：5 | 主题：269414
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[求助]如何使用Arlequin来计算Fst,Fis
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这个帖子发布于10年零10天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
请问在群体遗传学调查分析时,以算出STR等位基因频率,而没有计算单倍型,如何应用该软件来计算这两项指标?我是初学者,非常感谢大家不吝赐教!
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我现在也在计算基因频率，希望各位帮助指点一二。
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不知道你们是怎么用的，我也不会，想学下
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